RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488421.1

ATG2B-204, Transcript of autophagy related 2B, humanhuman

TSL 4

Gene ATG2B, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2B-204ENST00000488421 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 CSADQ9Y600 493 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 GSTT1P30711 240 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 ZP2Q05996 745 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG2B-204ENST00000488421 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.34□□□□□ -1.23
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ATG2B-204ENST00000488421 MAPK1P28482 360 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 MESP2Q0VG99 397 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 LRRC14Q15048 493 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.32□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 CLCN7P51798 805 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.31□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 FAM84AQ96KN4 292 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 ENC1O14682 589 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 NTF4P34130 210 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 RING1Q06587 406 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 FBF1Q8TES7 1133 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 FOXQ1Q9C009 403 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 GIPC1O14908 333 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 FBXO24O75426 580 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 PAGE1O75459 146 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 AFMP43652 599 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 MAPK8P45983 427 aa7.29□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.29□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 LRIG2O94898 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 EOMESO95936 686 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 MLANAQ16655 118 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-204ENST00000488421 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.27□□□□□ -1.24
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ATG2B-204ENST00000488421 C1QL4Q86Z23 238 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 ATP2B2Q01814 1243 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 HDXQ7Z353 690 aa7.26□□□□□ -1.25
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ATG2B-204ENST00000488421 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 BRD1O95696 1058 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 SLITRK5O94991 958 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 RAP1GAPP47736 663 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 INPP5AQ14642 412 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 RASIP1Q5U651 963 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 MFSD4AQ8N468 514 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ATG2B-204ENST00000488421 KIRREL1Q96J84 757 aa7.24□□□□□ -1.25
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