RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 GLI1P08151 1106 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ARNTP27540 789 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ERVK-24P63145 666 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 C12orf40Q86WS4 652 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.16□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 NFIBO00712 420 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CSRNP1Q96S65 589 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 B8ZZF3 427 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 H3BS24 57 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 PRRG2O14669 202 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 EOMESO95936 686 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 CLCN7P51798 805 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 FOXQ1Q9C009 403 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 NCANO14594 1321 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 NME2P22392 152 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.12□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 FBXO24O75426 580 aa6.11□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 NTF4P34130 210 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 FGD1P98174 961 aa6.11□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.11□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.11□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 CITED4Q96RK1 184 aa6.1□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 PAGE1O75459 146 aa6.09□□□□□ -1.43
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SENP6-210ENST00000487548 GDNFP39905 211 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 MFSD4AQ8N468 514 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 MIPEPQ99797 713 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.09□□□□□ -1.43
SENP6-210ENST00000487548 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 SLITRK5O94991 958 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 KCNA10Q16322 511 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.08□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 FANCGO15287 622 aa6.07□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.07□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 TTC6Q86TZ1 520 aa6.07□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.07□□□□□ -1.44
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SENP6-210ENST00000487548 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.07□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 FBRSQ9HAH7 460 aa6.07□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.07□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 NUAK1O60285 661 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 LRIG2O94898 1065 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RAC2P15153 192 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 BMP6P22004 513 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 HK2P52789 917 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 ERVFC1P60507 584 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 RASIP1Q5U651 963 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 SAMM50Q9Y512 469 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-210ENST00000487548 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.05□□□□□ -1.44
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