RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF214Q8ND24 703 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 HELQQ8TDG4 1101 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRELD1Q96HD1 420 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCTD3Q9Y597 815 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLIQ9UNA4 740 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERVK-24P63145 666 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 HPXP02790 462 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 INSRRP14616 1297 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEPSINQ96N21 525 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 OVOL3O00110 214 aa7.28□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDCA8Q53HL2 280 aa7.28□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.28□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.27□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 EOMESO95936 686 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 SP8Q8IXZ3 490 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 MFSD4AQ8N468 514 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK32AQ8WU08 396 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEPT3Q9UH03 358 aa7.26□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.25□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.25□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR20Q99678 358 aa7.25□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BS24 57 aa7.24□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF605Q86T29 641 aa7.24□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 LILRA2Q8N149 483 aa7.24□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF32Q9H0A6 362 aa7.24□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPSTP25325 297 aa7.23□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLP2Q04941 152 aa7.23□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRRDQ9UH36 339 aa7.23□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 PALD1Q9ULE6 856 aa7.23□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 HK2P52789 917 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERVFC1P60507 584 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 AAMPQ13685 434 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCM1Q9NP62 436 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D1-211ENST00000486539 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCT2Q8NC54 265 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 EHD4Q9H223 541 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSPNQ14714 243 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNB2Q92953 911 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZXDAP98168 799 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 GJD3Q8N144 294 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2FQ969M7 185 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRAK3Q9Y616 596 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDZD3Q86UT5 571 aa7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.18□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR33A8MZF0 331 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PI3P19957 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP2B4P23634 1241 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 OXR1Q8N573 874 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCGO15287 622 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms