RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ESR2Q92731 530 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MXD3Q9BW11 206 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DACT1Q9NYF0 836 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 UBR3Q6ZT12 1888 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MYH13Q9UKX3 1938 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZMYM6O95789 1325 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 NR1I2O75469 434 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PLCD1P51178 756 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DOK7Q18PE1 504 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 FANCBQ8NB91 859 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 FBXW7Q969H0 707 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ALG1Q9BT22 464 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CFAP45Q9UL16 551 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CACNA1SQ13698 1873 aa4.81□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KIF28PB7ZC32 967 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ATP2B4P23634 1241 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CHRNA5P30532 468 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 USP5P45974 858 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ME1P48163 572 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SEC23AQ15436 765 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 IQCA1Q86XH1 822 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SP8Q8IXZ3 490 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 TMTC2Q8N394 836 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MPNDQ8N594 471 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ELP1O95163 1332 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 BAG3O95817 575 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 IL1R1P14778 569 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 TROAPQ12815 778 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KRT40Q6A162 431 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 BICD2Q8TD16 824 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MTMR7Q9Y216 660 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CLIC4Q9Y696 253 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 COL24A1Q17RW2 1714 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ARAP2Q8WZ64 1704 aa4.8□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DOCK2Q92608 1830 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 TSPY2A6NKD2 308 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 BTBD18B2RXH4 712 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CDKL5O76039 1030 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 NPR1P16066 1061 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 IFNAR1P17181 557 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ALDH1B1P30837 517 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 PDE6BP35913 854 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 SCNN1DP51172 638 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 TFAP4Q01664 338 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 RTN1Q16799 776 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 C12orf60Q5U649 245 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CERS5Q8N5B7 392 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 FLAD1Q8NFF5 587 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 CASZ1Q86V15 1759 aa4.79□□□□□ -1.64
USP25-208ENST00000478932 USP17L3A6NCW0 530 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms