RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SHQ1-207ENST00000475558 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.4□□□□□ -1.06
SHQ1-207ENST00000475558 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SHQ1-207ENST00000475558 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MED23Q9ULK4 1368 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 PSMA5P28066 241 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ADORA1P30542 326 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MCM2P49736 904 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 BCAMP50895 628 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 KRT32Q14532 448 aa8.39□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 DACT2Q5SW24 774 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.39□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 MCAMP43121 646 aa8.38□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 RABEP1Q15276 862 aa8.38□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 APPBP2Q92624 585 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MAP4K1Q92918 833 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 FBXW7Q969H0 707 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 IL17RAQ96F46 866 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.38□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 TRIM17Q9Y577 477 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 UNCXA6NJT0 531 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 BAG3O95817 575 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 GYG1P46976 350 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MAP3K11Q16584 847 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ERO1AQ96HE7 468 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 CD209Q9NNX6 404 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 HSPA4P34932 840 aa8.36□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 RASGRF1Q13972 1273 aa8.36□□□□□ -1.07
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SHQ1-207ENST00000475558 ALX1Q15699 326 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 SNX21Q969T3 373 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MAST3O60307 1309 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 GTF2IP78347 998 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGEF6Q15052 776 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 NECTIN1Q15223 517 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 KCNB2Q92953 911 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 WNK4Q96J92 1243 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 RAI14Q9P0K7 980 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-207ENST00000475558 ABCF2Q9UG63 623 aa8.35□□□□□ -1.07
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