RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 RTP1P59025 263 aa18.24■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.24■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 FAM196BA6NMK8 535 aa18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 MAP3K10Q02779 954 aa18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 BADQ92934 168 aa18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 KAZALD1Q96I82 304 aa18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.23■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 ENTPD3O75355 529 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PICALMQ13492 652 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 GRIN2CQ14957 1233 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PPM1EQ8WY54 764 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PLXNB2O15031 1838 aa18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PDE3AQ14432 1141 aa18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 IDI2Q9BXS1 227 aa18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SOGA3-206ENST00000474293 PTPRFP10586 1907 aa18.2■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 FGFR2P21802 821 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 USP6NLQ92738 828 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 TTC28Q96AY4 2481 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 CNGA1P29973 690 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 RGS2P41220 211 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 Q3C1V9 767 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 PORCNQ9H237 461 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 DOCK2Q92608 1830 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 DOCK1Q14185 1865 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 MUC3AQ02505 3323 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.17■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 GPR142Q7Z601 462 aa18.17■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 VAMP4O75379 141 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 SLC5A1P13866 664 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 MAPK4P31152 587 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 MORN1Q5T089 497 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 ASB2Q96Q27 587 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 APBA2Q99767 749 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 KIF16BQ96L93 1317 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 CDH23Q9H251 3354 aa18.16■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 LTBP2Q14767 1821 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 DNM1LO00429 736 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 HERVK_113P62684 666 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 MTMR2Q13614 643 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 TRIM60Q495X7 471 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 LPAR1Q92633 364 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SOGA3-206ENST00000474293 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 USP17L5A8MUK1 530 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 ALDH1L1O75891 902 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 TBC1D12O60347 775 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 BTDP43251 543 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 EPHB4P54760 987 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 ERVK-9P63128 1117 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 ERVK-24P63145 666 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 LPIN2Q92539 896 aa18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SOGA3-206ENST00000474293 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms