RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SBF1	O95248	1867 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	EVX2	Q03828	476 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	GPR162	Q16538	588 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	GPC2	Q8N158	579 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	GRIN3B	O60391	1043 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ENTPD3	O75355	529 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	MYH1	P12882	1939 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	MYO1B	O43795	1136 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	CACNB3	P54284	484 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	EVC	P57679	992 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	PRDM1	O75626	825 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ME3	Q16798	604 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	WNT10B	O00744	389 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	LARGE1	O95461	756 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	LIFR	P42702	1097 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	APOBR	Q0VD83	1088 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	TCP10	Q12799	353 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	IQCA1	Q86XH1	822 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ERICH2	A1L162	156 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	CDK8	P49336	464 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	TMTC2	Q8N394	836 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	EHD4	Q9H223	541 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140		H7C1D1	291 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	GABPA	Q06546	454 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SWAP70	Q9UH65	585 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	LY9	Q9HBG7	655 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
MTA1-209	ENST00000469140	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	PFKFB2	O60825	505 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	RASA1	P20936	1047 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	WTAP	Q15007	396 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TFAP4	Q01664	338 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	NECAB1	Q8N987	351 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	GTF3C6	Q969F1	213 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TNKS	O95271	1327 aa		27.68	■■■□□ 2.02

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