RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 SBK1Q52WX2 424 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 CERS3Q8IU89 383 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.89■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 CLRN2A0PK11 232 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 PRC1O43663 620 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 BRF1Q92994 677 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SPDYE6P0CI01 402 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 GPR162Q16538 588 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 RNF181Q9P0P0 153 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 MCM5P33992 734 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 DLGAP5Q15398 846 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ME3Q16798 604 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SENP2Q9HC62 589 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 FGD1P98174 961 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 APOBRQ0VD83 1088 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 NECAB1Q8N987 351 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 STK3Q13188 491 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 MICALL2Q8IY33 904 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 FGRP09769 529 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ST3GAL1Q11201 340 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 WNT10BO00744 389 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 KRT23Q9C075 422 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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CAPN3-209ENST00000466222 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 IDI2Q9BXS1 227 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.83■■□□□ 1.09
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CAPN3-209ENST00000466222 PKP1Q13835 747 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPN3-209ENST00000466222 NMT2O60551 498 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 BRD1O95696 1058 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 MBD3O95983 291 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD1Q15327 319 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ESPNB1AK53 854 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ESR2Q92731 530 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 VEZTQ9HBM0 779 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 FAM196BA6NMK8 535 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CDK8P49336 464 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 PDE4BQ07343 736 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 DPF2Q92785 391 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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CAPN3-209ENST00000466222 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ORC4O43929 436 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 GPC2Q8N158 579 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 LY9Q9HBG7 655 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 EPS15P42566 896 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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