RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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PTPRU-206ENST00000465525 GGA3Q9NZ52 723 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-206ENST00000465525 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRU-206ENST00000465525 TNNI2P48788 182 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRU-206ENST00000465525 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRU-206ENST00000465525 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.39■□□□□ 0.86
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PTPRU-206ENST00000465525 FGRP09769 529 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRU-206ENST00000465525 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-206ENST00000465525 ORC4O43929 436 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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PTPRU-206ENST00000465525 TTC14Q96N46 770 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 ADM5C9JUS6 153 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 RASA1P20936 1047 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 AK2P54819 239 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 CHADLQ6NUI6 762 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 ESR2Q92731 530 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-206ENST00000465525 EHD4Q9H223 541 aa20.32■□□□□ 0.84
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