RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKCQQ04759 706 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 INPP5AQ14642 412 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 KCT2Q8NC54 265 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF19AQ9NV58 838 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 VAV3Q9UKW4 847 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 AK5Q9Y6K8 562 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ITIH2P19823 946 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 CD8BP10966 210 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ASIC4Q96FT7 647 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGB5P18084 799 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 CD96P40200 585 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 AOC3Q16853 763 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 HDXQ7Z353 690 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 BIN1O00499 593 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 LRIG2O94898 1065 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 LMNB1P20700 586 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 FUT4P22083 530 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 EOMESO95936 686 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 FBRSQ9HAH7 460 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.195e-13■□□□□ 9
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK8P49336 464 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPT6Q14141 434 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP3K11Q16584 847 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 LCE3BQ5TA77 95 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PARP2Q9UGN5 583 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGGTB-204ENST00000461653 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMD2Q13200 908 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXQ1Q9C009 403 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SLITRK5O94991 958 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PAPLNO95428 1278 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 DAB2P98082 770 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 NKG7Q16617 165 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.59□□□□□ -1.19
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RABGGTB-204ENST00000461653 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 HID1Q8IV36 788 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 ASB11Q8WXH4 323 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 MIPEPQ99797 713 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 GRK4P32298 578 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 CLCN7P51798 805 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 GFRA2O00451 464 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 IKZF1Q13422 519 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM161BQ96MY7 647 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-204ENST00000461653 RLBP1P12271 317 aa7.55□□□□□ -1.2
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