RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SMPD1P17405 629 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB27AP51159 221 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GPLD1P80108 840 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP11AP98196 1134 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC7A5Q01650 507 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TNP2Q05952 138 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP7Q14244 749 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf80Q86SX3 495 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 AHI1Q8N157 1196 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MARK1Q9P0L2 795 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F8A0AVK6 867 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 J3QW42 95 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF10CO14798 259 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP10O43572 662 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GHRHP01286 108 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 BRD3Q15059 726 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS72Q15906 364 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LONRF3Q496Y0 759 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PDZD3Q86UT5 571 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 HPS1Q92902 700 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 EVI5LQ96CN4 794 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG4CQ96DT6 458 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A13Q96H72 371 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 STRN4Q9NRL3 753 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DACH1Q9UI36 760 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.11□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GFRA2O00451 464 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3BP5O60239 455 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PPFIA4O75335 1185 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SDSP20132 328 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NEUROD1Q13562 356 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PCSK7Q16549 785 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM209AQ5JX71 171 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZNB5 142 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC8Q8TAM2 541 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX13Q9UN79 622 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.1□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PQU0 124 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GDF9O60383 454 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NPTXRO95502 500 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NAT2P11245 290 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PAX3P23760 479 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK8P49336 464 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ITKQ08881 620 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 AP3B2Q13367 1082 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR1Q13613 665 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LAPTM4AQ15012 233 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GNPTABQ3T906 1256 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SV2CQ496J9 727 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP135Q66GS9 1140 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PASD1Q8IV76 773 aa6.09□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17RAQ96F46 866 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms