RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436927.5

NVL-204, Transcript of nuclear VCP-like, human

TSL 3

Gene NVL, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NVL-204	ENST00000436927	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ZNF862	O60290	1169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	LIG1	P18858	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	GJD3	Q8N144	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ABCA8	O94911	1581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	GLI1	P08151	1106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	AFM	P43652	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ID3	Q02535	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	GLI2	P10070	1586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ZP2	Q05996	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	EEA1	Q15075	1411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NVL-204	ENST00000436927	ATP10B	O94823	1461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	FAM13A	O94988	1023 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	NEFM	P07197	916 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	IKZF1	Q13422	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	AAMP	Q13685	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ISL2	Q96A47	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	NFIB	O00712	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ITIH2	P19823	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	SSFA2	P28290	1259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	INHBB	P09529	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	HOXA5	P20719	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	GDNF	P39905	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	CLCN7	P51798	805 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	CTSW	P56202	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	ERVK-24	P63145	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	KCNA10	Q16322	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NVL-204	ENST00000436927	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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