RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428824.4

POU5F1P3-201, Transcript of POU class 5 homeobox 1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene POU5F1P3, Length 1,078 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1P3-201ENST00000428824 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.79■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.78■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 FLT3LGP49771 235 aa24.78■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 TEX11Q8IYF3 940 aa24.78■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 PNMA3Q9UL41 463 aa24.78■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 ADCY3O60266 1144 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 SPP2Q13103 211 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 TREML2Q5T2D2 321 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 GPR108Q9NPR9 543 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.77■■□□□ 1.56
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 CAP2P40123 477 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 IRF5Q13568 498 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 POLA2Q14181 598 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 TNNI3KQ59H18 835 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.75■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 ELNP15502 786 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 DPF3Q92784 378 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SNRKQ9NRH2 765 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.74■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 USP17L5A8MUK1 530 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 BAG3O95817 575 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 INHAP05111 366 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 PLCG2P16885 1265 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 HMGCS2P54868 508 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SSH3Q8TE77 659 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 COA7Q96BR5 231 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SIPA1L1O43166 1804 aa24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SGPL1O95470 568 aa24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 ATP8B2P98198 1209 aa24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.72■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 PPP4CP60510 307 aa24.71■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.71■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.7■■□□□ 1.55
POU5F1P3-201ENST00000428824 IGSF3O75054 1194 aa24.7■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 CAPN2P17655 700 aa24.7■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 FOCADQ5VW36 1801 aa24.7■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 WDR18Q9BV38 432 aa24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.69■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 FLT1P17948 1338 aa24.68■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 ASNSP08243 561 aa24.68■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.68■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZAP70P43403 619 aa24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 DEFB118Q96PH6 123 aa24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 DNAJC18Q9H819 358 aa24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 BACE1P56817 501 aa24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 MTMR2Q13614 643 aa24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.66■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.65■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.65■■□□□ 1.54
POU5F1P3-201ENST00000428824 GINM1Q9NU53 330 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms