RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 PDE4BQ07343 736 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 NTRK3Q16288 839 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 H0YIN7 160 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 PRDM1O75626 825 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RTN1Q16799 776 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.1■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP39-202ENST00000409025 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CYP2D6P10635 497 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 STYK1Q6J9G0 422 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ALG1Q9BT22 464 aa22.09■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 STK36Q9NRP7 1315 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 USP17L8P0C7I0 530 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 BTDP43251 543 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 GTF2IP78347 998 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 OLFM4Q6UX06 510 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 PHKBQ93100 1093 aa22.08■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
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USP39-202ENST00000409025 C12orf60Q5U649 245 aa22.08■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 EYA3Q99504 573 aa22.08■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 NT5C2P49902 561 aa22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 PPP2R5BQ15173 497 aa22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 FANCBQ8NB91 859 aa22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.07■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 EVX2Q03828 476 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 WASF1Q92558 559 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 G3V3G9 751 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 BRAPQ7Z569 592 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 FBXW7Q969H0 707 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 TRIM29Q14134 588 aa22.05■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.05■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 GAKO14976 1311 aa22.05■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP39-202ENST00000409025 TEX11Q8IYF3 940 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 AIFM3Q96NN9 605 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 USP28Q96RU2 1077 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 PANK2Q9BZ23 570 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 TSPY2A6NKD2 308 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CALM1P0DP23 149 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CALM2P0DP24 149 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CALM3P0DP25 149 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 BAG6P46379 1132 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 DOK7Q18PE1 504 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CNKSR1Q969H4 720 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 KRT40Q6A162 431 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 KLHL34Q8N239 644 aa22.02■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 PGBD1Q96JS3 809 aa22.02■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 TSPY26PQ9H489 355 aa22.02■■□□□ 1.12
USP39-202ENST00000409025 DDAH1O94760 285 aa22.02■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 RBSNQ9H1K0 784 aa22.02■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DEXIO95424 95 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CHRNA5P30532 468 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 RHBDL3P58872 404 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 NBPF11Q86T75 865 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 BICD2Q8TD16 824 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.01■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 LIG1P18858 919 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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