RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 CNTNAP1P78357 1384 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 H7C1D1 291 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 FOCADQ5VW36 1801 aa21.14■□□□□ 0.98
UBXN6-202ENST00000394765 ST18O60284 1047 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 Q6ZUG5 572 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 PRC1O43663 620 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 DTNBO60941 627 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SNX21Q969T3 373 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SENP2Q9HC62 589 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 LAMB1P07942 1786 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 LARGE1O95461 756 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 FGRP09769 529 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TRDNQ13061 729 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 HACL1Q9UJ83 578 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 MYO1BO43795 1136 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 DNAJC18Q9H819 358 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 NMT2O60551 498 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 CDK8P49336 464 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 HSCBQ8IWL3 235 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 BRF1Q92994 677 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 GLTPD2A6NH11 291 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ENTPD3O75355 529 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 MCM5P33992 734 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 GABPAQ06546 454 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 DLK2Q6UY11 383 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 MYH1P12882 1939 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TTC6Q86TZ1 520 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 KRT23Q9C075 422 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 POTECB2RU33 542 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 PDE4BQ07343 736 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 CSRNP1Q96S65 589 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ORC4O43929 436 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 RASA1P20936 1047 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 APOBRQ0VD83 1088 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 RASA3Q14644 834 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 FAM151AQ8WW52 585 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 ESR2Q92731 530 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 TMX3Q96JJ7 454 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 GGA3Q9NZ52 723 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN6-202ENST00000394765 FGD1P98174 961 aa21.08■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 SIPA1L1O43166 1804 aa21.08■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 HLA-DOAP06340 250 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 SHMT1P34896 483 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 MMP14P50281 582 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 TFAP4Q01664 338 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 ME3Q16798 604 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 ST3GAL1Q11201 340 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 STK3Q13188 491 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 BECN1Q14457 450 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 TSPY2A6NKD2 308 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 NECAB1Q8N987 351 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 TEPSINQ96N21 525 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 LY9Q9HBG7 655 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 AKR1B1P15121 316 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN6-202ENST00000394765 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms