RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 WTAPQ15007 396 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FLT1P17948 1338 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TRAK2O60296 914 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NMT2O60551 498 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PLCG2P16885 1265 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SEC23AQ15436 765 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FERMT3Q86UX7 667 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MICU3Q86XE3 530 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 USP40Q9NVE5 1235 aa18.01■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC69A6NI79 296 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ORC4O43929 436 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PICALMQ13492 652 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FAM184AQ8NB25 1140 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD1Q99460 953 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 COL4A5P29400 1685 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 UTRNP46939 3433 aa18■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TNKSO95271 1327 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB43O43298 467 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PTGER2P43116 358 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CRKP46108 304 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PDE4BQ07343 736 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TEKT1Q969V4 418 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FOCADQ5VW36 1801 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ERICH2A1L162 156 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 RAD17O75943 681 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PDCP20941 246 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CERS3Q8IU89 383 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.99■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.98■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.98■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CPLX1O14810 134 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TFAP4Q01664 338 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MTA3Q9BTC8 594 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MKNK2Q9HBH9 465 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CACNB3P54284 484 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GUCY1B3Q02153 619 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TMTC2Q8N394 836 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 PHKBQ93100 1093 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.97■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NFIAQ12857 509 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NTRK3Q16288 839 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 IQCA1Q86XH1 822 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ZFPM1Q8IX07 1006 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GJB4Q9NTQ9 266 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.96■□□□□ 0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TSPY2A6NKD2 308 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 H3BQV1 296 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD14O00487 310 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CDK8P49336 464 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IFFO2Q5TF58 517 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MRIQ9BWK5 157 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SLURP2P0DP57 97 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC82Q8N4S0 544 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 AIFM3Q96NN9 605 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 BCS1LQ9Y276 419 aa17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CASQ1-201ENST00000368078 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms