RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R7Q15435 360 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SLAIN2Q9P270 581 aa22.68■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 IL17REQ8NFR9 667 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP2AO43633 222 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ERO1AQ96HE7 468 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CBX8Q9HC52 389 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 STX10O60499 249 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP3P21580 790 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.67■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 JAK2O60674 1132 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 EVCP57679 992 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP12P59046 1061 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC169A6NNP5 214 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TFAP4Q01664 338 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB16Q05516 673 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 IFT74Q96LB3 600 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ERBB4Q15303 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.66■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 EBAG9O00559 213 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF75DP51815 510 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 H0YIN7 160 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 BRD1O95696 1058 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC25Q86WR0 208 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 SPOPO43791 374 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 POSTNQ15063 836 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TICAM2Q86XR7 235 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MNAT1P51948 309 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 MXRA7P84157 204 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 HOOK2Q96ED9 719 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 CSRNP2Q9H175 543 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 DNM3Q9UQ16 869 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-203ENST00000366687 GRM1Q13255 1194 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 HDXQ7Z353 690 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 GTF3C6Q969F1 213 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CTSWP56202 376 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SSH2Q76I76 1423 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC63Q8NA47 563 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP6O43182 974 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 KRT5P13647 590 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 PHKG2P15735 406 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 KRT9P35527 623 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC6Q16204 474 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 PDE6BP35913 854 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 VPS18Q9P253 973 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 KDRP35968 1356 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF11Q86T75 865 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SMC6Q96SB8 1091 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CALCRLQ16602 461 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC114Q96M63 670 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZEB2O60315 1214 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 INF2Q27J81 1249 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 PPARAQ07869 468 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ME3Q16798 604 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 CA8P35219 290 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 ASIC2Q16515 512 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM23A6NLE4 172 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-203ENST00000366687 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms