RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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SPNS3-201ENST00000355530 FANCLQ9NW38 375 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 KIF20AO95235 890 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SLIT2O94813 1529 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 DISP2A7MBM2 1401 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 BTBD18B2RXH4 712 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 PTPREP23469 700 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 POSTNQ15063 836 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 KRT222Q8N1A0 295 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 DACH1Q9UI36 760 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 DEXIO95424 95 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TDO2P48775 406 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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SPNS3-201ENST00000355530 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ERICH2A1L162 156 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 BMP6P22004 513 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TMTC2Q8N394 836 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MLKLQ8NB16 471 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MYH6P13533 1939 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN12O43309 604 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 GUCY1A2P33402 732 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 LAMB2P55268 1798 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 PHLPP1O60346 1717 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM232C9JQI7 657 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP6O43182 974 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 PDE4BQ07343 736 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 INTS13Q9NVM9 706 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 LCORLQ8N3X6 602 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 DNAI1Q9UI46 699 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 FOXN1O15353 648 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 KANK3Q6NY19 840 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCE1Q969G3 411 aa20.9■□□□□ 0.94
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SPNS3-201ENST00000355530 TOMM22Q9NS69 142 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SPECC1Q5M775 1068 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 PRKAB2O43741 272 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF18P17022 549 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 MORC3Q14149 939 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM139Q8IV31 216 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.89■□□□□ 0.93
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SPNS3-201ENST00000355530 RTL9Q8NET4 1388 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.88■□□□□ 0.93
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SPNS3-201ENST00000355530 GRIN1Q05586 938 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 FANCBQ8NB91 859 aa20.87■□□□□ 0.93
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SPNS3-201ENST00000355530 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 PRR29P0C7W0 189 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA2P54652 639 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R5BQ15173 497 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 BTG4Q9NY30 223 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPNS3-201ENST00000355530 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
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