RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 FOXN1O15353 648 aa22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 SMC2O95347 1197 aa22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 IFNAR1P17181 557 aa22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 15.2
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TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 NGLY1Q96IV0 654 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.38■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 FANCBQ8NB91 859 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 DYNC1I1O14576 645 aa22.37■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM205CA6NFA0 338 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 USP27XA6NNY8 438 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 IFNKQ9P0W0 207 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 NRAPQ86VF7 1730 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 GNPATO15228 680 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 NPHP1O15259 732 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 NMT2O60551 498 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 MMP1P03956 469 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.36■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF11Q86T75 865 aa22.36■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 PDILTQ8N807 584 aa22.36■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 RTL9Q8NET4 1388 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 PRDX5P30044 214 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 BARGINQ6ZT62 677 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF592Q92610 1267 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP1A3P13637 1013 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 UBE4AQ14139 1066 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L12C9JPN9 530 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L21D6R901 530 aa22.35■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 NLRP12P59046 1061 aa22.35■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 JMYQ8N9B5 988 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 ESR2Q92731 530 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 SHISA4Q96DD7 197 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 SETDB2Q96T68 719 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 CABP5Q9NP86 173 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP6R2O75170 966 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 CNNM3Q8NE01 707 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 HPSEQ9Y251 543 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC25BP30305 580 aa22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3-201ENST00000343028 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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TM7SF3-201ENST00000343028 CYP2D6P10635 497 aa22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 MECOMQ03112 1051 aa22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 RESP18Q5W5W9 173 aa22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 USP49Q70CQ1 688 aa22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 TMC6Q7Z403 805 aa22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 BCORQ6W2J9 1755 aa22.33■■□□□ 1.16
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TM7SF3-201ENST00000343028 SEC23AQ15436 765 aa22.32■■□□□ 1.16
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TM7SF3-201ENST00000343028 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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TM7SF3-201ENST00000343028 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 STK36Q9NRP7 1315 aa22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.31■■□□□ 1.16
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