RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 PDE6AP16499 860 aa24.86■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 ITGA6P23229 1130 aa24.86■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 CASP1P29466 404 aa24.86■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.86■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 STX10O60499 249 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 CSF1RP07333 972 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 OXER1Q8TDS5 423 aa24.85■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 SNAP23O00161 211 aa24.84■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 MMP1P03956 469 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 MORC3Q14149 939 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 TMEM87BQ96K49 555 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 RAI14Q9P0K7 980 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 COBLO75128 1261 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 STX17P56962 302 aa24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ELL3-201ENST00000319359 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 HLFQ16534 295 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 AIDAQ96BJ3 306 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MYH7P12883 1935 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 FAM205CA6NFA0 338 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PRKAB2O43741 272 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PTPREP23469 700 aa24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MST1RQ04912 1400 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ARMT1Q9H993 441 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 TOMM22Q9NS69 142 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 NR1I3Q14994 352 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 FUT8Q9BYC5 575 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CSRNP2Q9H175 543 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.81■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 A0A087X0B3 334 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 TPM1P09493 284 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CAPN2P17655 700 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 UBE3CQ15386 1083 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 FBXO3Q9UK99 471 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MYO1BO43795 1136 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MBD4O95243 580 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MLKLQ8NB16 471 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.8■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 AFMP43652 599 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 RBL2Q08999 1139 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 H3BQF6 201 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 FAM193AP78312 1265 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 NAPBQ9H115 298 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CABP5Q9NP86 173 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ABCC12Q96J65 1359 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ATRNO75882 1429 aa24.79■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ABL1P00519 1130 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 IFNAR1P17181 557 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 SHISA4Q96DD7 197 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 EPSTI1Q96J88 318 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 GOLGA1Q92805 767 aa24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 ATF3P18847 181 aa24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ELL3-201ENST00000319359 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms