RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP7A1P22680 504 aa18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.64■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAF5O00463 557 aa18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 LDHCP07864 332 aa18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 BTDP43251 543 aa18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 CNPY2Q9Y2B0 182 aa18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 GAKO14976 1311 aa18.63■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SULF1Q8IWU6 871 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 USP40Q9NVE5 1235 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DOCK2Q92608 1830 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE6AP16499 860 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 FSTL1Q12841 308 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZUG5 572 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 PDCP20941 246 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 RBSNQ9H1K0 784 aa18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SYCE3A1L190 88 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 STK3Q13188 491 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 M0R2C6 588 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 C1QTNF8P60827 252 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 OSBP2Q969R2 916 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 ADD2P35612 726 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TCP10Q12799 353 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 BAG3O95817 575 aa18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 NFIAQ12857 509 aa18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RASA3Q14644 834 aa18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RHBDL3P58872 404 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2HP62256 183 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 PICALMQ13492 652 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF3C6Q969F1 213 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 E7EWF7 191 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 FGD1P98174 961 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CDCA5Q96FF9 252 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMA4Q16363 1823 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 MYH7P12883 1935 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 PASKQ96RG2 1323 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 IGSF3O75054 1194 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFAIP1Q13829 316 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX11Q8IYF3 940 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 BRF1Q92994 677 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 FIBPO43427 364 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 TNNI2P48788 182 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CNTNAP1P78357 1384 aa18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP4CP60510 307 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms