RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC7A5Q01650 507 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 AIDAQ96BJ3 306 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF10O15013 1369 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 BTBD18B2RXH4 712 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEBLO76041 1014 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 KAZALD1Q96I82 304 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 METP08581 1390 aa16.65■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF609O15014 1411 aa16.64■□□□□ 0.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZPR1O75312 459 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 BMP6P22004 513 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 HOXC9P31274 260 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 E2F5Q15329 346 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQUBQ8NA54 791 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 C2orf54Q08AI8 447 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF185O15231 689 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPAINQ86UA6 219 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOA7Q8NI08 942 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMS19Q96T76 1030 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.64■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCP2P22307 547 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IRAK1P51617 712 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC181Q5TID7 509 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP49Q70CQ1 688 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBXN1Q04323 297 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IFT81Q8WYA0 676 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 MLKLQ8NB16 471 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHP1Q99653 195 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 INCENPQ9NQS7 918 aa16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 B4E1Z4 1266 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R2C6 588 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IDEP14735 1019 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CXCR5P32302 372 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNGA4Q8IV77 575 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGAP02671 866 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERCC3P19447 782 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPARAQ07869 468 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAST3O60307 1309 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IFT88Q13099 833 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CABP5Q9NP86 173 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAA25Q14CX7 972 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 OSBP2Q969R2 916 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC114Q96M63 670 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV5-2P06315 115 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ODF2Q5BJF6 829 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 HAUS7Q99871 368 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPLO60437 1756 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCKRQ14397 625 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 PI16Q6UXB8 463 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CABS1Q96KC9 395 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAB21Q9UL25 225 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB43O43298 467 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 MFAP3LO75121 409 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 NR5A1Q13285 461 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 BACH1O14867 736 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDKL5O76039 1030 aa16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP27A1Q02318 531 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms