RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.17■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP6O43182 974 aa28.17■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 CIAO1O76071 339 aa28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 FGAP02671 866 aa28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 ISM2Q6H9L7 571 aa28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.16■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 GREM2Q9H772 168 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM232C9JQI7 657 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 SERPINC1P01008 464 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP100Q494V2 611 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 HDXQ7Z353 690 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 VSTM4Q8IW00 320 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 GPATCH11Q8N954 259 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 DEF6Q9H4E7 631 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.15■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PQ27 194 aa28.14■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PQ64 194 aa28.14■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PQD8 194 aa28.14■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 IKBKBO14920 756 aa28.14■■■□□ 2.1
PKDCC-201ENST00000294964 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC31Q6UY01 552 aa28.14■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 KCNQ2O43526 872 aa28.13■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 METTL24Q5JXM2 366 aa28.13■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa28.13■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SBF2Q86WG5 1849 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CBFA2T2O43439 604 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 ITGA6P23229 1130 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 E2F4Q16254 413 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.12■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CHMP4BP1P59074 171 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 POTEAQ6S8J7 498 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SNAP23O00161 211 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 MCAMP43121 646 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.11■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PNKPQ96T60 521 aa28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 NHSQ6T4R5 1651 aa28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.1■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PRC1O43663 620 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF202O95125 648 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 RXRAP19793 462 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 USP5P45974 858 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 L1RE1Q9UN81 338 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 GPAA1O43292 621 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 ABCB6Q9NP58 842 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CLIC4Q9Y696 253 aa28.09■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 KARSQ15046 597 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 STK38Q15208 465 aa28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.08■■■□□ 2.09
PKDCC-201ENST00000294964 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.08■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 INCENPQ9NQS7 918 aa28.08■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 RAB21Q9UL25 225 aa28.08■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 CUTAO60888 179 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 CPP00450 1065 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 CSF1RP07333 972 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 RXRBP28702 533 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 ANTXR2P58335 489 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 CNNM3Q8NE01 707 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 PHACTR2O75167 634 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP10Q86W26 655 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.07■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 IDH1O75874 414 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 MYL5Q02045 173 aa28.06■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 DESI2Q9BSY9 194 aa28.06■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PKDCC-201ENST00000294964 INTS13Q9NVM9 706 aa28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms