RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.29□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PPME1Q9Y570 386 aa13.29□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF790Q6PG37 636 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP2A1O14983 1001 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 GYG1P46976 350 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PARD3BQ8TEW8 1205 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 INF2Q27J81 1249 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SAT1P21673 171 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA24Q86W54 205 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 POLIQ9UNA4 740 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.28□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 TACC1O75410 805 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE6BP35913 854 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SH3TC1Q8TE82 1336 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 ZEB2O60315 1214 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 DCLK2Q8N568 766 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.27□□□□□ -0.28
UBASH3B-201ENST00000284273 KIFAP3Q92845 792 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 POLKQ9UBT6 870 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ASXL2Q76L83 1435 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCC1P33527 1531 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 RAD17O75943 681 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 GSDMDP57764 484 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SLAIN2Q9P270 581 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NCOA1Q15788 1441 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NUCB1Q02818 461 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF5AQ12840 1032 aa13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 BNIP3LO60238 219 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CHMP6Q96FZ7 201 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP2J2P51589 502 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB33Q86T24 672 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SDR42E1Q8WUS8 393 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 FLOT1O75955 427 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM7Q9C029 511 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 IFNKQ9P0W0 207 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 BICDL2A1A5D9 508 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF653Q96CK0 615 aa13.26□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ZAP70P43403 619 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CALCRLQ16602 461 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NLRX1Q86UT6 975 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM227BQ96M60 508 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 GPAA1O43292 621 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ADCY7P51828 1080 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 TFAP4Q01664 338 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA5Q8NB90 893 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NAA25Q14CX7 972 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CTAGE9A4FU28 777 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPN9O14815 690 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 NR1I2O75469 434 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 GMNNO75496 209 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SKILP12757 684 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ITIH3Q06033 890 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ABI1Q8IZP0 508 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF532Q9HCE3 1301 aa13.25□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 ALDH1L1O75891 902 aa13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SMC6Q96SB8 1091 aa13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 AKT3Q9Y243 479 aa13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.7 ms