RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262429.8

ATP2C2-201, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C2, Length 3,376 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2-201ENST00000262429 MXD3Q9BW11 206 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 CPLX1O14810 134 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 ADCY5O95622 1261 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 MMP10P09238 476 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 CD209Q9NNX6 404 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.59□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.58□□□□□ -0.07
ATP2C2-201ENST00000262429 ZBTB43O43298 467 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 RXRBP28702 533 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 OGFRQ9NZT2 677 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SEMA3EO15041 775 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 PLSCR1O15162 318 aa14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 C6orf229H3BNL8 230 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 C8orf76Q96K31 380 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 TMEM87BQ96K49 555 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 GGA1Q9UJY5 639 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CCDC66A2RUB6 948 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 NR1I2O75469 434 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KRT23Q9C075 422 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CLIC4Q9Y696 253 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 TNKSO95271 1327 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CCDC69A6NI79 296 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 WTAPQ15007 396 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SEC23AQ15436 765 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SHISA4Q96DD7 197 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 UVSSAQ2YD98 709 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 DACT1Q9NYF0 836 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SRGNP10124 158 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 LIFRP42702 1097 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ALG1Q9BT22 464 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 A0A087WWV3 80 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 DOK7Q18PE1 504 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ANKRD7Q92527 254 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 F8W031 263 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ELP1O95163 1332 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 BBOX1O75936 387 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 PLCD1P51178 756 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 FBXW7Q969H0 707 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 LTBP1Q14766 1721 aa14.54□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 KRT40Q6A162 431 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 SLURP2P0DP57 97 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 ATP2B4P23634 1241 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 GTF2IP78347 998 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 NBPF11Q86T75 865 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.53□□□□□ -0.08
ATP2C2-201ENST00000262429 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms