RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TRIM37O94972 964 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 KRT13P13646 458 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 POLA2Q14181 598 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 WDR78Q5VTH9 848 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 LTN1O94822 1766 aa7.14□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PQ64 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PQD8 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 KIAA0754O94854 1291 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 TYRO3Q06418 890 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 INCENPQ9NQS7 918 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 RETREG2Q8NC44 543 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 TRIM47Q96LD4 638 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CEP83Q9Y592 693 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SIK1P57059 783 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CSRNP2Q9H175 543 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ATP2A1O14983 1001 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 PALLDQ8WX93 1383 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 E7EWF7 191 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 N4BP3O15049 544 aa7.13□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 GBP1P32455 592 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.13□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 IVLP07476 585 aa7.13□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 ANO1Q5XXA6 986 aa7.13□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.13□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SHTN1A0MZ66 631 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 GNPATO15228 680 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SCP2P22307 547 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 USP21Q9UK80 565 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SUCLG2Q96I99 432 aa7.12□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 TACC1O75410 805 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 GSDMAQ96QA5 445 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 BCRP11274 1271 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 APOBRQ0VD83 1088 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 TEX11Q8IYF3 940 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.12□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 UTYO14607 1347 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 LGR6Q9HBX8 967 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CDHR1Q96JP9 859 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 STK32BQ9NY57 414 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 UQCRHP07919 91 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 FERMT3Q86UX7 667 aa7.12□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.12□□□□□ -1.27
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