RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 CPA4Q9UI42 421 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 MGAMO43451 1857 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 PDHXO00330 501 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 CYP7A1P22680 504 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 PRMT2P55345 433 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 MAP3K12Q12852 859 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 MOGSQ13724 837 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 TRIM47Q96LD4 638 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 PSMC4P43686 418 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 SRRDQ9UH36 339 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.46■■□□□ 1.83
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NME4-201ENST00000219479 PPP4CP60510 307 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.46■■□□□ 1.83
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NME4-201ENST00000219479 MAP3K10Q02779 954 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 MTFR1Q15390 333 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 CERS3Q8IU89 383 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 SHISA4Q96DD7 197 aa26.45■■□□□ 1.82
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NME4-201ENST00000219479 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 TBC1D12O60347 775 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 PTPRAP18433 802 aa26.43■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.43■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 DOCK1Q14185 1865 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 FLT1P17948 1338 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 FAM196BA6NMK8 535 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 CXCL11O14625 94 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 SLURP2P0DP57 97 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.42■■□□□ 1.82
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NME4-201ENST00000219479 H0YGN5 161 aa26.41■■□□□ 1.82
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NME4-201ENST00000219479 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 CYP2C8P10632 490 aa26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 BCRP11274 1271 aa26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 GRK4P32298 578 aa26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 USP5P45974 858 aa26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 HLA-DOAP06340 250 aa26.39■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.39■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
NME4-201ENST00000219479 TRIM75PA6NK02 468 aa26.38■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 PALD1Q9ULE6 856 aa26.38■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 PRKCZQ05513 592 aa26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 PDE6AP16499 860 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 ATP5JP18859 108 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 FCGRTP55899 365 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 CCL5P13501 91 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 CAP2P40123 477 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 GJA8P48165 433 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 GJB1P08034 283 aa26.34■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.34■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NME4-201ENST00000219479 GPATCH3Q96I76 525 aa26.34■■□□□ 1.81
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