RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 KDM4AO75164 1064 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 C16orf86Q6ZW13 317 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 EHD4Q9H223 541 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 EVX2Q03828 476 aa18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 GABPAQ06546 454 aa18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.53■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 LIFRP42702 1097 aa18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 PICALMQ13492 652 aa18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 BRF1Q92994 677 aa18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 RNF181Q9P0P0 153 aa18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TMED1-201ENST00000214869 FGD1P98174 961 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 GPR162Q16538 588 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ME3Q16798 604 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CHST3Q7LGC8 479 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 FAM83AQ86UY5 434 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 MICALL2Q8IY33 904 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SWAP70Q9UH65 585 aa18.51■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SHTN1A0MZ66 631 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 WNT10BO00744 389 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 MYO1BO43795 1136 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 HLA-DOAP06340 250 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 DDIT3P35638 169 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CDK8P49336 464 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 TMTC2Q8N394 836 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 FAM151AQ8WW52 585 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 LY9Q9HBG7 655 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 TOMM22Q9NS69 142 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CNTNAP1P78357 1384 aa18.5■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 PFKFB2O60825 505 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 LARGE1O95461 756 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 RASA1P20936 1047 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CACNB3P54284 484 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SEC23AQ15436 765 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 PI4KBQ9UBF8 816 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 H7C1D1 291 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 PRDM1O75626 825 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 APOBRQ0VD83 1088 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 IQCA1Q86XH1 822 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ANKS1AQ92625 1134 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 RCAN1P53805 252 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ST3GAL1Q11201 340 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 GTF3C6Q969F1 213 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 NID2Q14112 1375 aa18.47■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 CLRN2A0PK11 232 aa18.47■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 ERICH2A1L162 156 aa18.47■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 TCP10Q12799 353 aa18.47■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.47■□□□□ 0.55
TMED1-201ENST00000214869 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms