RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000197314.4

Usp53-202, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Usp53, Length 3,586 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53-202ENSMUST00000197314 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ampd3O08739 766 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cdcp1Q5U462 833 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Kcnj14Q8JZN3 434 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Adck5Q80V03 582 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Q8BZJ8 459 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Gas1Q01721 343 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Strip1Q8C079 837 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cep89Q9CZX2 791 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Col11a2Q64739 1736 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Col20a1Q923P0 1320 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Prr16A3KMN5 304 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 XpcP51612 930 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 NfixP70257 488 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Kif22Q3V300 660 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Slc27a1Q60714 646 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ttll4Q80UG8 1193 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Syt10Q9R0N4 523 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Zscan20B2KFW1 1030 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cavin1O54724 392 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tmed8Q3UHI4 326 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ccdc51Q3URS9 406 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ankrd13dQ6PD24 605 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ano10Q8BH79 659 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tspyl4Q8VD63 406 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Epb41l3Q9WV92 929 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Bend4P86174 541 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Etnk1Q9D4V0 363 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Nucb2P81117 420 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Arhgef16Q3U5C8 713 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Fchsd1Q6PFY1 688 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Haus7Q8BKT8 364 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Trim11Q99PQ2 467 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ly75Q60767 1723 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cyp3a25O09158 503 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Slurp2P0DP59 97 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ell2Q3UKU1 639 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Mum1l1Q4VA55 681 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Stxbp4Q9WV89 557 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Samd1D3YXK1 519 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 TbcaP48428 108 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cep131Q62036 1060 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Rec8Q8C5S7 591 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Uba5Q8VE47 403 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Fam89aQ14BJ1 175 aa14.52□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tmtc2Q56A06 836 aa14.52□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tmem179Q8BHH9 233 aa14.52□□□□□ -0.08
Usp53-202ENSMUST00000197314 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Traf3ip1Q149C2 625 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Cyp7b1Q60991 507 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ccdc94Q9D6J3 314 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tob2Q9JM55 345 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Chd5A2A8L1 1946 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Prl2c1Q5SVL9 228 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Nrbp1Q99J45 535 aa14.52□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Dapk3O54784 448 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Psd3Q2PFD7 1037 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Sox30Q8CGW4 782 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ubap1lG3UW59 384 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Slc1a4O35874 532 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ints4Q8CIM8 964 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ubac1Q8VDI7 409 aa14.51□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 NcapgE9PWG6 1004 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Nmt2O70311 529 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Myo1bP46735 1107 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Gpatch11Q3UFS4 262 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tfcp2Q9ERA0 502 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tpd52l1O54818 204 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 UvssaQ9D479 717 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ppp4cP97470 307 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Tlcd1Q99JT6 247 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ankrd1Q9CR42 319 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Fam114a1Q9D281 569 aa14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Usp53-202ENSMUST00000197314 Atp8b5A3FIN4 1183 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 78.1 ms