RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CNTNAP2-222	ENST00000637694		M0R2T5	61 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1X	P80297	61 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT2A	P02795	61 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1F	P04733	61 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1B	P07438	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KMT2D	O14686	5537 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEB	P20929	6669 aa		2.9	□□□□□ -1.95
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.88	□□□□□ -1.95
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		2.84	□□□□□ -1.96
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1L	Q93083	61 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-9	P26371	169 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1E	P04732	61 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRM1	P04553	51 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1G	P13640	62 aa		2.65	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		2.65	□□□□□ -1.98
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2E	P22531	72 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2B	P35325	72 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2A	P35326	72 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPRR2D	P22532	72 aa		2.54	□□□□□ -2
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1A	P04731	61 aa		2.54	□□□□□ -2
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.53	□□□□□ -2
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT1M	Q8N339	61 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.42	□□□□□ -2.02
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		2.4	□□□□□ -2.03
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.38	□□□□□ -2.03
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.34	□□□□□ -2.04
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT3	P25713	68 aa		2.32	□□□□□ -2.04
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.29	□□□□□ -2.04
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MT4	P47944	62 aa		2.27	□□□□□ -2.05
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.26	□□□□□ -2.05
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.19	□□□□□ -2.06
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.15	□□□□□ -2.06
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.07	□□□□□ -2.08
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.06	□□□□□ -2.08
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.06	□□□□□ -2.08
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.88	□□□□□ -2.11
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	1.88	□□□□□ -2.11
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC5AC	P98088	5654 aa		1.86	□□□□□ -2.11
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE1C	Q5T751	118 aa		1.8	□□□□□ -2.12
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		1.8	□□□□□ -2.12
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.8	□□□□□ -2.12
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.72	□□□□□ -2.13
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.52	□□□□□ -2.17
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.27	□□□□□ -2.21
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.85	□□□□□ -2.27

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