RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.64□□□□□ -1.99
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.63□□□□□ -1.99
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.6□□□□□ -1.99
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.58□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.58□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 LCE3AQ5TA76 89 aa2.58□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.58□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.58□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.57□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.57□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 A0A0D9SG42 100 aa2.55□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 R4GN34 69 aa2.54□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.53□□□□□ -2
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP10-10P60014 251 aa2.52□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.52□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 PLAC4Q8WY50 150 aa2.51□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 K7ERS5 55 aa2.51□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 KMT2DO14686 5537 aa2.47□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 MT1EP04732 61 aa2.46□□□□□ -2.01
PCAT5-201ENST00000626667 TNP1P09430 55 aa2.44□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 MT1LQ93083 61 aa2.43□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 M0R2T5 61 aa2.43□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.43□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.41□□□□□ -2.02
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP12-3P60328 96 aa2.38□□□□□ -2.03
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-9P26371 169 aa2.37□□□□□ -2.03
PCAT5-201ENST00000626667 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.35□□□□□ -2.03
PCAT5-201ENST00000626667 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.32□□□□□ -2.04
PCAT5-201ENST00000626667 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.3□□□□□ -2.04
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.25□□□□□ -2.05
PCAT5-201ENST00000626667 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PCAT5-201ENST00000626667 MT1MQ8N339 61 aa2.24□□□□□ -2.05
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.22□□□□□ -2.05
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.2□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 MT1AP04731 61 aa2.19□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 INE1O15225 51 aa2.18□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.18□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 MT1GP13640 62 aa2.16□□□□□ -2.06
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.14□□□□□ -2.07
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.1□□□□□ -2.07
PCAT5-201ENST00000626667 NEBP20929 6669 aa2.09□□□□□ -2.07
PCAT5-201ENST00000626667 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PCAT5-201ENST00000626667 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.07□□□□□ -2.08
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.05□□□□□ -2.08
PCAT5-201ENST00000626667 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.03□□□□□ -2.08
PCAT5-201ENST00000626667 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.03□□□□□ -2.09
PCAT5-201ENST00000626667 MDN1Q9NU22 5596 aa2.02□□□□□ -2.09
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2□□□□□ -2.09
PCAT5-201ENST00000626667 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.99□□□□□ -2.09
PCAT5-201ENST00000626667 LCE1CQ5T751 118 aa1.92□□□□□ -2.1
PCAT5-201ENST00000626667 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.92□□□□□ -2.1
PCAT5-201ENST00000626667 SPRR2EP22531 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PCAT5-201ENST00000626667 SPRR2BP35325 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PCAT5-201ENST00000626667 SPRR2AP35326 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PCAT5-201ENST00000626667 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.85□□□□□ -2.11
PCAT5-201ENST00000626667 SPRR2DP22532 72 aa1.82□□□□□ -2.12
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.82□□□□□ -2.12
PCAT5-201ENST00000626667 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.8□□□□□ -2.12
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP12-4P60329 112 aa1.7□□□□□ -2.14
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.7□□□□□ -2.14
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.68□□□□□ -2.14
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP5-8O75690 187 aa1.65□□□□□ -2.15
PCAT5-201ENST00000626667 MT4P47944 62 aa1.64□□□□□ -2.15
PCAT5-201ENST00000626667 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.62□□□□□ -2.15
PCAT5-201ENST00000626667 MUC5ACP98088 5654 aa1.58□□□□□ -2.16
PCAT5-201ENST00000626667 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.56□□□□□ -2.16
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.52□□□□□ -2.17
PCAT5-201ENST00000626667 PRM1P04553 51 aa1.51□□□□□ -2.17
PCAT5-201ENST00000626667 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
PCAT5-201ENST00000626667 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.36□□□□□ -2.19
PCAT5-201ENST00000626667 PHGR1C9JFL3 82 aa1.21□□□□□ -2.22
PCAT5-201ENST00000626667 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.96□□□□□ -2.26
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