RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MUC1-222	ENST00000610468	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0D9SG42	100 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MUC1-222	ENST00000610468	MT1E	P04732	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MUC1-222	ENST00000610468	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MUC1-222	ENST00000610468	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MUC1-222	ENST00000610468	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MUC1-222	ENST00000610468	ROMO1	P60602	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MUC1-222	ENST00000610468	MT1G	P13640	62 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MUC1-222	ENST00000610468	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MUC1-222	ENST00000610468	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC1-222	ENST00000610468	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC1-222	ENST00000610468	PP632	Q6XCG6	107 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC1-222	ENST00000610468	MT4	P47944	62 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC1-222	ENST00000610468	MT1M	Q8N339	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC1-222	ENST00000610468	MT1L	Q93083	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC1-222	ENST00000610468	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC1-222	ENST00000610468	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC1-222	ENST00000610468	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC1-222	ENST00000610468	TNP1	P09430	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.41	□□□□□ -1.7
MUC1-222	ENST00000610468	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
MUC1-222	ENST00000610468	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	MT1A	P04731	61 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MUC1-222	ENST00000610468	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MUC1-222	ENST00000610468	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MUC1-222	ENST00000610468	MT3	P25713	68 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0A0MQY5	61 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MUC1-222	ENST00000610468	INE1	O15225	51 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MUC1-222	ENST00000610468	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MUC1-222	ENST00000610468	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MUC1-222	ENST00000610468	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MUC1-222	ENST00000610468	PRM1	P04553	51 aa		2.59	□□□□□ -1.99
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.54	□□□□□ -2
MUC1-222	ENST00000610468	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.48	□□□□□ -2.01
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.16	□□□□□ -2.06
MUC1-222	ENST00000610468	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.7	□□□□□ -2.14

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