RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.79□□□□□ -1.64
FCHO1-228ENST00000599236 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.79□□□□□ -1.64
FCHO1-228ENST00000599236 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.79□□□□□ -1.64
FCHO1-228ENST00000599236 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.77□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 LCE3AQ5TA76 89 aa4.77□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP12-1P59990 96 aa4.76□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.76□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 PCP4P48539 62 aa4.73□□□□□ -1.65
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
FCHO1-228ENST00000599236 PRR15LQ9BU68 103 aa4.67□□□□□ -1.66
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1B0GU69 56 aa4.66□□□□□ -1.66
FCHO1-228ENST00000599236 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.64□□□□□ -1.67
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1B0GU33 70 aa4.63□□□□□ -1.67
FCHO1-228ENST00000599236 V9GYY9 64 aa4.63□□□□□ -1.67
FCHO1-228ENST00000599236 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
FCHO1-228ENST00000599236 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.59□□□□□ -1.67
FCHO1-228ENST00000599236 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP12-4P60329 112 aa4.58□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.56□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 A8MU10 97 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 TNP1P09430 55 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 Q1T7F1 81 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP12-3P60328 96 aa4.54□□□□□ -1.68
FCHO1-228ENST00000599236 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
FCHO1-228ENST00000599236 UQCR11O14957 56 aa4.5□□□□□ -1.69
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.47□□□□□ -1.69
FCHO1-228ENST00000599236 MUC5ACP98088 5654 aa4.46□□□□□ -1.7
FCHO1-228ENST00000599236 PSPHP1O15172 72 aa4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-228ENST00000599236 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.39□□□□□ -1.71
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-8O75690 187 aa4.35□□□□□ -1.71
FCHO1-228ENST00000599236 K7ERS5 55 aa4.33□□□□□ -1.72
FCHO1-228ENST00000599236 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.33□□□□□ -1.72
FCHO1-228ENST00000599236 A6NED7 52 aa4.31□□□□□ -1.72
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.28□□□□□ -1.72
FCHO1-228ENST00000599236 MT1AP04731 61 aa4.21□□□□□ -1.74
FCHO1-228ENST00000599236 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.21□□□□□ -1.74
FCHO1-228ENST00000599236 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.16□□□□□ -1.74
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.14□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.12□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.11□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.04□□□□□ -1.76
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.03□□□□□ -1.76
FCHO1-228ENST00000599236 ROMO1P60602 79 aa4.03□□□□□ -1.76
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.01□□□□□ -1.77
FCHO1-228ENST00000599236 BRK1Q8WUW1 75 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-228ENST00000599236 MT3P25713 68 aa3.85□□□□□ -1.79
FCHO1-228ENST00000599236 PMAIP1Q13794 54 aa3.83□□□□□ -1.8
FCHO1-228ENST00000599236 PRO0628Q9UI54 55 aa3.81□□□□□ -1.8
FCHO1-228ENST00000599236 LCE1EQ5T753 118 aa3.61□□□□□ -1.83
FCHO1-228ENST00000599236 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.55□□□□□ -1.84
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.53□□□□□ -1.84
FCHO1-228ENST00000599236 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.49□□□□□ -1.85
FCHO1-228ENST00000599236 PRAC1Q96KF2 57 aa3.49□□□□□ -1.85
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.39□□□□□ -1.87
FCHO1-228ENST00000599236 LCE1CQ5T751 118 aa3.37□□□□□ -1.87
FCHO1-228ENST00000599236 SVIPQ8NHG7 77 aa3.3□□□□□ -1.88
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.15□□□□□ -1.91
FCHO1-228ENST00000599236 LUZP6Q538Z0 58 aa3.07□□□□□ -1.92
FCHO1-228ENST00000599236 LCE1FQ5T754 118 aa3.05□□□□□ -1.92
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
FCHO1-228ENST00000599236 PHGR1C9JFL3 82 aa3□□□□□ -1.93
FCHO1-228ENST00000599236 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.82□□□□□ -1.96
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.7□□□□□ -1.98
FCHO1-228ENST00000599236 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.7□□□□□ -1.98
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFAF8A1L188 74 aa2.65□□□□□ -1.99
FCHO1-228ENST00000599236 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.65□□□□□ -1.99
FCHO1-228ENST00000599236 A0A0A0MQY5 61 aa2.36□□□□□ -2.03
FCHO1-228ENST00000599236 INE1O15225 51 aa2.3□□□□□ -2.04
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.24□□□□□ -2.05
FCHO1-228ENST00000599236 PRM1P04553 51 aa2.01□□□□□ -2.09
FCHO1-228ENST00000599236 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.88□□□□□ -2.11
FCHO1-228ENST00000599236 H3BS24 57 aa1.72□□□□□ -2.13
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