RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-9P26371 169 aa5.06□□□□□ -1.6
FCHO1-227ENST00000598960 MT1LQ93083 61 aa5.06□□□□□ -1.6
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.99□□□□□ -1.61
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.97□□□□□ -1.61
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.97□□□□□ -1.61
FCHO1-227ENST00000598960 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.93□□□□□ -1.62
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.92□□□□□ -1.62
FCHO1-227ENST00000598960 MT1GP13640 62 aa4.9□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.88□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.87□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 MT1MQ8N339 61 aa4.87□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 MDN1Q9NU22 5596 aa4.86□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.85□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2EP22531 72 aa4.84□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2BP35325 72 aa4.84□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2AP35326 72 aa4.84□□□□□ -1.63
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.75□□□□□ -1.65
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.74□□□□□ -1.65
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.74□□□□□ -1.65
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.68□□□□□ -1.66
FCHO1-227ENST00000598960 LUZP6Q538Z0 58 aa4.68□□□□□ -1.66
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2DP22532 72 aa4.66□□□□□ -1.66
FCHO1-227ENST00000598960 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.56□□□□□ -1.68
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-227ENST00000598960 NDUFAF8A1L188 74 aa4.54□□□□□ -1.68
FCHO1-227ENST00000598960 LCE3BQ5TA77 95 aa4.48□□□□□ -1.69
FCHO1-227ENST00000598960 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.48□□□□□ -1.69
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-227ENST00000598960 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
FCHO1-227ENST00000598960 MT1AP04731 61 aa4.31□□□□□ -1.72
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.25□□□□□ -1.73
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.22□□□□□ -1.73
FCHO1-227ENST00000598960 LCE4AQ5TA78 99 aa4.15□□□□□ -1.75
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-227ENST00000598960 H3BS24 57 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-227ENST00000598960 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP12-4P60329 112 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-227ENST00000598960 MT4P47944 62 aa4.03□□□□□ -1.76
FCHO1-227ENST00000598960 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.01□□□□□ -1.77
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-227ENST00000598960 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1DQ5T752 114 aa3.99□□□□□ -1.77
FCHO1-227ENST00000598960 A0A0A0MQY5 61 aa3.97□□□□□ -1.77
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.94□□□□□ -1.78
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.91□□□□□ -1.78
FCHO1-227ENST00000598960 MT3P25713 68 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.85□□□□□ -1.79
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.83□□□□□ -1.8
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.8□□□□□ -1.8
FCHO1-227ENST00000598960 INE1O15225 51 aa3.75□□□□□ -1.81
FCHO1-227ENST00000598960 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.68□□□□□ -1.82
FCHO1-227ENST00000598960 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.59□□□□□ -1.83
FCHO1-227ENST00000598960 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.5□□□□□ -1.85
FCHO1-227ENST00000598960 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.42□□□□□ -1.86
FCHO1-227ENST00000598960 MUC5ACP98088 5654 aa3.39□□□□□ -1.87
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1EQ5T753 118 aa3.38□□□□□ -1.87
FCHO1-227ENST00000598960 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-8O75690 187 aa3.3□□□□□ -1.88
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.3□□□□□ -1.88
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.18□□□□□ -1.9
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.16□□□□□ -1.9
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.15□□□□□ -1.91
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1CQ5T751 118 aa3.14□□□□□ -1.91
FCHO1-227ENST00000598960 PRM1P04553 51 aa3.11□□□□□ -1.91
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.81□□□□□ -1.96
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.78□□□□□ -1.96
FCHO1-227ENST00000598960 LCE1FQ5T754 118 aa2.53□□□□□ -2
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.46□□□□□ -2.02
FCHO1-227ENST00000598960 PHGR1C9JFL3 82 aa2.39□□□□□ -2.03
FCHO1-227ENST00000598960 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.04□□□□□ -2.08
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.89□□□□□ -2.11
FCHO1-227ENST00000598960 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.56□□□□□ -2.16
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