RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598067.5

FCHO1-223, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-223	ENST00000598067	MT4	P47944	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FCHO1-223	ENST00000598067	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FCHO1-223	ENST00000598067	MT1G	P13640	62 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FCHO1-223	ENST00000598067	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FCHO1-223	ENST00000598067	MT1M	Q8N339	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FCHO1-223	ENST00000598067		A6NED7	52 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	MT1L	Q93083	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067		K7ERS5	55 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FCHO1-223	ENST00000598067	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FCHO1-223	ENST00000598067	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FCHO1-223	ENST00000598067	TNP1	P09430	55 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.46	□□□□□ -1.7
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.33	□□□□□ -1.72
FCHO1-223	ENST00000598067	ROMO1	P60602	79 aa		4.32	□□□□□ -1.72
FCHO1-223	ENST00000598067	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.32	□□□□□ -1.72
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.31	□□□□□ -1.72
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.3	□□□□□ -1.72
FCHO1-223	ENST00000598067	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FCHO1-223	ENST00000598067	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FCHO1-223	ENST00000598067	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FCHO1-223	ENST00000598067	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FCHO1-223	ENST00000598067	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.02	□□□□□ -1.77
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4	□□□□□ -1.77
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FCHO1-223	ENST00000598067	MT1A	P04731	61 aa		3.94	□□□□□ -1.78
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.92	□□□□□ -1.78
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.82	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.82	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.81	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.81	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.81	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.8	□□□□□ -1.8
FCHO1-223	ENST00000598067	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FCHO1-223	ENST00000598067	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.72	□□□□□ -1.81
FCHO1-223	ENST00000598067	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.68	□□□□□ -1.82
FCHO1-223	ENST00000598067	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.62	□□□□□ -1.83
FCHO1-223	ENST00000598067	MT3	P25713	68 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.28	□□□□□ -1.88
FCHO1-223	ENST00000598067	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.26	□□□□□ -1.89
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.19	□□□□□ -1.9
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.86	□□□□□ -1.95
FCHO1-223	ENST00000598067	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.85	□□□□□ -1.95
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FCHO1-223	ENST00000598067	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FCHO1-223	ENST00000598067	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.65	□□□□□ -1.99
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.58	□□□□□ -2
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.5	□□□□□ -2.01
FCHO1-223	ENST00000598067		A0A0A0MQY5	61 aa		2.47	□□□□□ -2.01
FCHO1-223	ENST00000598067	INE1	O15225	51 aa		2.4	□□□□□ -2.03
FCHO1-223	ENST00000598067	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.34	□□□□□ -2.03
FCHO1-223	ENST00000598067	PRM1	P04553	51 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FCHO1-223	ENST00000598067		H3BS24	57 aa		1.99	□□□□□ -2.09
FCHO1-223	ENST00000598067	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.96	□□□□□ -2.1
FCHO1-223	ENST00000598067	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.58	□□□□□ -2.16

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