RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.27□□□□□ -1.73
FCHO1-208ENST00000595033 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.27□□□□□ -1.73
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.27□□□□□ -1.73
FCHO1-208ENST00000595033 MDN1Q9NU22 5596 aa4.25□□□□□ -1.73
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.16□□□□□ -1.74
FCHO1-208ENST00000595033 MT1EP04732 61 aa4.15□□□□□ -1.75
FCHO1-208ENST00000595033 MT1LQ93083 61 aa4.14□□□□□ -1.75
FCHO1-208ENST00000595033 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-208ENST00000595033 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-208ENST00000595033 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.08□□□□□ -1.76
FCHO1-208ENST00000595033 MT1GP13640 62 aa3.97□□□□□ -1.77
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.96□□□□□ -1.78
FCHO1-208ENST00000595033 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.92□□□□□ -1.78
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP12-4P60329 112 aa3.91□□□□□ -1.78
FCHO1-208ENST00000595033 MT1MQ8N339 61 aa3.91□□□□□ -1.78
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-208ENST00000595033 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.81□□□□□ -1.8
FCHO1-208ENST00000595033 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.81□□□□□ -1.8
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FCHO1-208ENST00000595033 SPRR2AP35326 72 aa3.8□□□□□ -1.8
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
FCHO1-208ENST00000595033 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.78□□□□□ -1.8
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.77□□□□□ -1.81
FCHO1-208ENST00000595033 LCE3BQ5TA77 95 aa3.75□□□□□ -1.81
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-9P26371 169 aa3.71□□□□□ -1.82
FCHO1-208ENST00000595033 SPRR2DP22532 72 aa3.62□□□□□ -1.83
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.6□□□□□ -1.83
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FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.58□□□□□ -1.84
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FCHO1-208ENST00000595033 PRM1P04553 51 aa3.5□□□□□ -1.85
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
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FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.32□□□□□ -1.88
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.31□□□□□ -1.88
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FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.28□□□□□ -1.88
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.22□□□□□ -1.89
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FCHO1-208ENST00000595033 LCE1DQ5T752 114 aa3.11□□□□□ -1.91
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.1□□□□□ -1.91
FCHO1-208ENST00000595033 MT3P25713 68 aa3.06□□□□□ -1.92
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.04□□□□□ -1.92
FCHO1-208ENST00000595033 LCE1EQ5T753 118 aa3.01□□□□□ -1.93
FCHO1-208ENST00000595033 LCE4AQ5TA78 99 aa2.97□□□□□ -1.93
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.86□□□□□ -1.95
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.84□□□□□ -1.96
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FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.66□□□□□ -1.98
FCHO1-208ENST00000595033 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.54□□□□□ -2
FCHO1-208ENST00000595033 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.54□□□□□ -2
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.53□□□□□ -2
FCHO1-208ENST00000595033 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.53□□□□□ -2.01
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.49□□□□□ -2.01
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-8O75690 187 aa2.48□□□□□ -2.01
FCHO1-208ENST00000595033 LCE1CQ5T751 118 aa2.35□□□□□ -2.03
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.34□□□□□ -2.04
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.31□□□□□ -2.04
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.26□□□□□ -2.05
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.23□□□□□ -2.05
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.19□□□□□ -2.06
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.16□□□□□ -2.06
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
FCHO1-208ENST00000595033 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.05□□□□□ -2.08
FCHO1-208ENST00000595033 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
FCHO1-208ENST00000595033 PHGR1C9JFL3 82 aa1.81□□□□□ -2.12
FCHO1-208ENST00000595033 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.19□□□□□ -2.22
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