RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ILF3-223	ENST00000593061	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ILF3-223	ENST00000593061	TNP1	P09430	55 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ILF3-223	ENST00000593061	MT1G	P13640	62 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ILF3-223	ENST00000593061	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ILF3-223	ENST00000593061	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.86	□□□□□ -1.31
ILF3-223	ENST00000593061	MT1M	Q8N339	61 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ILF3-223	ENST00000593061	MT1L	Q93083	61 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.83	□□□□□ -1.32
ILF3-223	ENST00000593061	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.77	□□□□□ -1.33
ILF3-223	ENST00000593061	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.74	□□□□□ -1.33
ILF3-223	ENST00000593061	ROMO1	P60602	79 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ILF3-223	ENST00000593061	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ILF3-223	ENST00000593061	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ILF3-223	ENST00000593061	MT4	P47944	62 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ILF3-223	ENST00000593061	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ILF3-223	ENST00000593061	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ILF3-223	ENST00000593061	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ILF3-223	ENST00000593061	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ILF3-223	ENST00000593061	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ILF3-223	ENST00000593061	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ILF3-223	ENST00000593061	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ILF3-223	ENST00000593061	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.03	□□□□□ -1.44
ILF3-223	ENST00000593061	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ILF3-223	ENST00000593061	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ILF3-223	ENST00000593061	MT1A	P04731	61 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ILF3-223	ENST00000593061	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ILF3-223	ENST00000593061	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ILF3-223	ENST00000593061	MT3	P25713	68 aa		5.32	□□□□□ -1.56
ILF3-223	ENST00000593061	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
ILF3-223	ENST00000593061	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ILF3-223	ENST00000593061	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ILF3-223	ENST00000593061	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5	□□□□□ -1.61
ILF3-223	ENST00000593061	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ILF3-223	ENST00000593061	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ILF3-223	ENST00000593061	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ILF3-223	ENST00000593061	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ILF3-223	ENST00000593061	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILF3-223	ENST00000593061	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ILF3-223	ENST00000593061	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0A0MQY5	61 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ILF3-223	ENST00000593061		H3BS24	57 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ILF3-223	ENST00000593061	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ILF3-223	ENST00000593061	INE1	O15225	51 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ILF3-223	ENST00000593061	PRM1	P04553	51 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ILF3-223	ENST00000593061	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ILF3-223	ENST00000593061	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.32	□□□□□ -2.04

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