RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		9.04	□□□□□ -0.96
GPS1-223	ENST00000584229	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		8.96	□□□□□ -0.98
GPS1-223	ENST00000584229	BRK1	Q8WUW1	75 aa		8.96	□□□□□ -0.98
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP12-3	P60328	96 aa		8.95	□□□□□ -0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MT1L	Q93083	61 aa		8.9	□□□□□ -0.98
GPS1-223	ENST00000584229	LCE3B	Q5TA77	95 aa		8.88	□□□□□ -0.99
GPS1-223	ENST00000584229	MT1G	P13640	62 aa		8.87	□□□□□ -0.99
GPS1-223	ENST00000584229	PP632	Q6XCG6	107 aa		8.86	□□□□□ -0.99
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		8.83	□□□□□ -1
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		8.78	□□□□□ -1
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		8.78	□□□□□ -1
GPS1-223	ENST00000584229	MT1M	Q8N339	61 aa		8.75	□□□□□ -1.01
GPS1-223	ENST00000584229	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		8.57	□□□□□ -1.04
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		8.53	□□□□□ -1.04
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		8.52	□□□□□ -1.05
GPS1-223	ENST00000584229	PMAIP1	Q13794	54 aa		8.41	□□□□□ -1.06
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		8.35	□□□□□ -1.07
GPS1-223	ENST00000584229	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		8.28	□□□□□ -1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PRO0628	Q9UI54	55 aa		8.17	□□□□□ -1.1
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		8.13	□□□□□ -1.11
GPS1-223	ENST00000584229	LCE4A	Q5TA78	99 aa		8.09	□□□□□ -1.11
GPS1-223	ENST00000584229	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		8.08	□□□□□ -1.12
GPS1-223	ENST00000584229	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		8.06	□□□□□ -1.12
GPS1-223	ENST00000584229	MT4	P47944	62 aa		8.02	□□□□□ -1.13
GPS1-223	ENST00000584229	PRAC1	Q96KF2	57 aa		8	□□□□□ -1.13
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.98	□□□□□ -1.13
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.97	□□□□□ -1.13
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GPS1-223	ENST00000584229	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GPS1-223	ENST00000584229	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP12-4	P60329	112 aa		7.66	□□□□□ -1.18
GPS1-223	ENST00000584229	MT1A	P04731	61 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GPS1-223	ENST00000584229	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GPS1-223	ENST00000584229	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPS1-223	ENST00000584229	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GPS1-223	ENST00000584229	MT3	P25713	68 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.76	□□□□□ -1.33
GPS1-223	ENST00000584229	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6.7	□□□□□ -1.34
GPS1-223	ENST00000584229	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GPS1-223	ENST00000584229	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1E	Q5T753	118 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GPS1-223	ENST00000584229	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GPS1-223	ENST00000584229	MUC5AC	P98088	5654 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GPS1-223	ENST00000584229	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.91	□□□□□ -1.46
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.86	□□□□□ -1.47
GPS1-223	ENST00000584229	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.15	□□□□□ -1.59
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0A0MQY5	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPS1-223	ENST00000584229	INE1	O15225	51 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPS1-223	ENST00000584229	PRM1	P04553	51 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPS1-223	ENST00000584229	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GPS1-223	ENST00000584229	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GPS1-223	ENST00000584229		H3BS24	57 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GPS1-223	ENST00000584229	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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