RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	TNP1	P09430	55 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5	□□□□□ -1.61
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK1D-208	ENST00000578501		A6NED7	52 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT1G	P13640	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501		K7ERS5	55 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT1L	Q93083	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT4	P47944	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT1M	Q8N339	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSNK1D-208	ENST00000578501	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK1D-208	ENST00000578501	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK1D-208	ENST00000578501	ROMO1	P60602	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT1A	P04731	61 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSNK1D-208	ENST00000578501	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSNK1D-208	ENST00000578501	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSNK1D-208	ENST00000578501	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT3	P25713	68 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSNK1D-208	ENST00000578501	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSNK1D-208	ENST00000578501		H3BS24	57 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSNK1D-208	ENST00000578501	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A0A0MQY5	61 aa		3.27	□□□□□ -1.89
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.26	□□□□□ -1.89
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CSNK1D-208	ENST00000578501	INE1	O15225	51 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.89	□□□□□ -1.95
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.42	□□□□□ -2.02
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRM1	P04553	51 aa		2.32	□□□□□ -2.04
CSNK1D-208	ENST00000578501	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.3	□□□□□ -2.04
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSNK1D-208	ENST00000578501	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.64	□□□□□ -2.15

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