RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGAE-202ENST00000570360 PRO0628Q9UI54 55 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGAE-202ENST00000570360 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGAE-202ENST00000570360 PMAIP1Q13794 54 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGAE-202ENST00000570360 MT1EP04732 61 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGAE-202ENST00000570360 MDN1Q9NU22 5596 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.23□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 NEBP20929 6669 aa6.23□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR2EP22531 72 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR2BP35325 72 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR2AP35326 72 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP12-3P60328 96 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGAE-202ENST00000570360 PP632Q6XCG6 107 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.13□□□□□ -1.43
ITGAE-202ENST00000570360 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGAE-202ENST00000570360 MT1LQ93083 61 aa6.11□□□□□ -1.43
ITGAE-202ENST00000570360 A0A0A0MQY5 61 aa6.07□□□□□ -1.44
ITGAE-202ENST00000570360 MT1GP13640 62 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 PRAC1Q96KF2 57 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR2DP22532 72 aa6□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.99□□□□□ -1.45
ITGAE-202ENST00000570360 MT1MQ8N339 61 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGAE-202ENST00000570360 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-202ENST00000570360 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGAE-202ENST00000570360 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGAE-202ENST00000570360 MT1AP04731 61 aa5.2□□□□□ -1.58
ITGAE-202ENST00000570360 MT4P47944 62 aa5.2□□□□□ -1.58
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.16□□□□□ -1.58
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.15□□□□□ -1.59
ITGAE-202ENST00000570360 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.1□□□□□ -1.59
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP12-4P60329 112 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGAE-202ENST00000570360 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGAE-202ENST00000570360 LUZP6Q538Z0 58 aa4.89□□□□□ -1.63
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGAE-202ENST00000570360 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGAE-202ENST00000570360 NDUFAF8A1L188 74 aa4.73□□□□□ -1.65
ITGAE-202ENST00000570360 MT3P25713 68 aa4.7□□□□□ -1.66
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGAE-202ENST00000570360 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.58□□□□□ -1.68
ITGAE-202ENST00000570360 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.32□□□□□ -1.72
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.31□□□□□ -1.72
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-8O75690 187 aa4.3□□□□□ -1.72
ITGAE-202ENST00000570360 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.26□□□□□ -1.73
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.21□□□□□ -1.74
ITGAE-202ENST00000570360 LCE1EQ5T753 118 aa4.2□□□□□ -1.74
ITGAE-202ENST00000570360 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.09□□□□□ -1.75
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ITGAE-202ENST00000570360 LCE1FQ5T754 118 aa4.05□□□□□ -1.76
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.03□□□□□ -1.76
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ITGAE-202ENST00000570360 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.91□□□□□ -1.78
ITGAE-202ENST00000570360 LCE1CQ5T751 118 aa3.9□□□□□ -1.79
ITGAE-202ENST00000570360 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ITGAE-202ENST00000570360 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
ITGAE-202ENST00000570360 INE1O15225 51 aa3.7□□□□□ -1.82
ITGAE-202ENST00000570360 PRM1P04553 51 aa3.4□□□□□ -1.87
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.39□□□□□ -1.87
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-202ENST00000570360 PHGR1C9JFL3 82 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-202ENST00000570360 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.61□□□□□ -1.99
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.01□□□□□ -2.09
ITGAE-202ENST00000570360 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.97□□□□□ -2.09
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