RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.54□□□□□ -1.52
CMTM3-215ENST00000568477 LCE3BQ5TA77 95 aa5.52□□□□□ -1.53
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.46□□□□□ -1.54
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.42□□□□□ -1.54
CMTM3-215ENST00000568477 MT1EP04732 61 aa5.39□□□□□ -1.55
CMTM3-215ENST00000568477 TNP1P09430 55 aa5.38□□□□□ -1.55
CMTM3-215ENST00000568477 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.36□□□□□ -1.55
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.35□□□□□ -1.55
CMTM3-215ENST00000568477 PP632Q6XCG6 107 aa5.3□□□□□ -1.56
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.29□□□□□ -1.56
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.28□□□□□ -1.56
CMTM3-215ENST00000568477 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CMTM3-215ENST00000568477 MT1GP13640 62 aa5.22□□□□□ -1.57
CMTM3-215ENST00000568477 LCE3AQ5TA76 89 aa5.15□□□□□ -1.59
CMTM3-215ENST00000568477 MT1LQ93083 61 aa5.14□□□□□ -1.59
CMTM3-215ENST00000568477 MT1MQ8N339 61 aa5.13□□□□□ -1.59
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.13□□□□□ -1.59
CMTM3-215ENST00000568477 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.1□□□□□ -1.59
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1DQ5T752 114 aa5.01□□□□□ -1.61
CMTM3-215ENST00000568477 LCE4AQ5TA78 99 aa5.01□□□□□ -1.61
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5□□□□□ -1.61
CMTM3-215ENST00000568477 MT4P47944 62 aa4.96□□□□□ -1.62
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP12-3P60328 96 aa4.96□□□□□ -1.62
CMTM3-215ENST00000568477 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.96□□□□□ -1.62
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.9□□□□□ -1.63
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.87□□□□□ -1.63
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.85□□□□□ -1.63
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.8□□□□□ -1.64
CMTM3-215ENST00000568477 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.8□□□□□ -1.64
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.71□□□□□ -1.66
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.71□□□□□ -1.66
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.67□□□□□ -1.66
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.63□□□□□ -1.67
CMTM3-215ENST00000568477 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.61□□□□□ -1.67
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP12-4P60329 112 aa4.61□□□□□ -1.67
CMTM3-215ENST00000568477 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.61□□□□□ -1.67
CMTM3-215ENST00000568477 LUZP6Q538Z0 58 aa4.57□□□□□ -1.68
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.56□□□□□ -1.68
CMTM3-215ENST00000568477 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.5□□□□□ -1.69
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFAF8A1L188 74 aa4.46□□□□□ -1.7
CMTM3-215ENST00000568477 MT1AP04731 61 aa4.38□□□□□ -1.71
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.34□□□□□ -1.71
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.32□□□□□ -1.72
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.29□□□□□ -1.72
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.24□□□□□ -1.73
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.22□□□□□ -1.73
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.16□□□□□ -1.74
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-8O75690 187 aa4.08□□□□□ -1.76
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.08□□□□□ -1.76
CMTM3-215ENST00000568477 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.02□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 MT3P25713 68 aa4.01□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 H3BS24 57 aa4□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0A0MQY5 61 aa3.98□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CMTM3-215ENST00000568477 MUC5ACP98088 5654 aa3.94□□□□□ -1.78
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.84□□□□□ -1.79
CMTM3-215ENST00000568477 INE1O15225 51 aa3.75□□□□□ -1.81
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1EQ5T753 118 aa3.69□□□□□ -1.82
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.58□□□□□ -1.84
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.48□□□□□ -1.85
CMTM3-215ENST00000568477 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.47□□□□□ -1.85
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1CQ5T751 118 aa3.41□□□□□ -1.86
CMTM3-215ENST00000568477 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.39□□□□□ -1.87
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.1□□□□□ -1.91
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1FQ5T754 118 aa3.02□□□□□ -1.93
CMTM3-215ENST00000568477 PRM1P04553 51 aa2.95□□□□□ -1.94
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.85□□□□□ -1.95
CMTM3-215ENST00000568477 PHGR1C9JFL3 82 aa2.73□□□□□ -1.97
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.63□□□□□ -1.99
CMTM3-215ENST00000568477 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.08□□□□□ -2.08
CMTM3-215ENST00000568477 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 267.7 ms