RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 LUZP6Q538Z0 58 aa6.7□□□□□ -1.34
INO80E-211ENST00000567987 MT1LQ93083 61 aa6.7□□□□□ -1.34
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP5-9P26371 169 aa6.69□□□□□ -1.34
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.64□□□□□ -1.35
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.64□□□□□ -1.35
INO80E-211ENST00000567987 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.61□□□□□ -1.35
INO80E-211ENST00000567987 MDN1Q9NU22 5596 aa6.59□□□□□ -1.35
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.59□□□□□ -1.35
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.54□□□□□ -1.36
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.53□□□□□ -1.36
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INO80E-211ENST00000567987 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.48□□□□□ -1.37
INO80E-211ENST00000567987 MT1MQ8N339 61 aa6.46□□□□□ -1.38
INO80E-211ENST00000567987 SPRR2EP22531 72 aa6.44□□□□□ -1.38
INO80E-211ENST00000567987 SPRR2BP35325 72 aa6.44□□□□□ -1.38
INO80E-211ENST00000567987 SPRR2AP35326 72 aa6.44□□□□□ -1.38
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.38□□□□□ -1.39
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INO80E-211ENST00000567987 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.86□□□□□ -1.47
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.84□□□□□ -1.47
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.81□□□□□ -1.48
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INO80E-211ENST00000567987 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.23□□□□□ -1.57
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INO80E-211ENST00000567987 PRM1P04553 51 aa4.38□□□□□ -1.71
INO80E-211ENST00000567987 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.25□□□□□ -1.73
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INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.2□□□□□ -1.74
INO80E-211ENST00000567987 LCE1CQ5T751 118 aa4.18□□□□□ -1.74
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.97□□□□□ -1.77
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INO80E-211ENST00000567987 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.69□□□□□ -1.82
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.55□□□□□ -1.84
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.34□□□□□ -1.88
INO80E-211ENST00000567987 LCE1FQ5T754 118 aa3.32□□□□□ -1.88
INO80E-211ENST00000567987 PHGR1C9JFL3 82 aa3.17□□□□□ -1.9
INO80E-211ENST00000567987 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.91□□□□□ -1.94
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INO80E-211ENST00000567987 MUC16Q8WXI7 14507 aa2□□□□□ -2.09
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