RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567065.5

INO80E-208, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-208ENST00000567065 ROMO1P60602 79 aa5.74□□□□□ -1.49
INO80E-208ENST00000567065 PRO0628Q9UI54 55 aa5.74□□□□□ -1.49
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.72□□□□□ -1.49
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.65□□□□□ -1.5
INO80E-208ENST00000567065 PMAIP1Q13794 54 aa5.64□□□□□ -1.51
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.59□□□□□ -1.51
INO80E-208ENST00000567065 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.59□□□□□ -1.51
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.55□□□□□ -1.52
INO80E-208ENST00000567065 LCE3AQ5TA76 89 aa5.53□□□□□ -1.52
INO80E-208ENST00000567065 MT1EP04732 61 aa5.51□□□□□ -1.53
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.5□□□□□ -1.53
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.49□□□□□ -1.53
INO80E-208ENST00000567065 LCE1DQ5T752 114 aa5.48□□□□□ -1.53
INO80E-208ENST00000567065 PP632Q6XCG6 107 aa5.47□□□□□ -1.53
INO80E-208ENST00000567065 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.45□□□□□ -1.54
INO80E-208ENST00000567065 SVIPQ8NHG7 77 aa5.45□□□□□ -1.54
INO80E-208ENST00000567065 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.4□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 MT1GP13640 62 aa5.37□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 LCE4AQ5TA78 99 aa5.37□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 MT4P47944 62 aa5.34□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP12-3P60328 96 aa5.34□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.34□□□□□ -1.55
INO80E-208ENST00000567065 MT1LQ93083 61 aa5.31□□□□□ -1.56
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.3□□□□□ -1.56
INO80E-208ENST00000567065 PRAC1Q96KF2 57 aa5.26□□□□□ -1.57
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.24□□□□□ -1.57
INO80E-208ENST00000567065 MT1MQ8N339 61 aa5.24□□□□□ -1.57
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.19□□□□□ -1.58
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.19□□□□□ -1.58
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.18□□□□□ -1.58
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.14□□□□□ -1.59
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.13□□□□□ -1.59
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.08□□□□□ -1.6
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.06□□□□□ -1.6
INO80E-208ENST00000567065 LCE3CQ5T5A8 94 aa5□□□□□ -1.61
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.95□□□□□ -1.62
INO80E-208ENST00000567065 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.89□□□□□ -1.63
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
INO80E-208ENST00000567065 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.78□□□□□ -1.64
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP12-4P60329 112 aa4.77□□□□□ -1.65
INO80E-208ENST00000567065 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.7□□□□□ -1.66
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.6□□□□□ -1.67
INO80E-208ENST00000567065 MT1AP04731 61 aa4.54□□□□□ -1.68
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.54□□□□□ -1.68
INO80E-208ENST00000567065 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
INO80E-208ENST00000567065 MUC5ACP98088 5654 aa4.49□□□□□ -1.69
INO80E-208ENST00000567065 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-8O75690 187 aa4.48□□□□□ -1.69
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.48□□□□□ -1.69
INO80E-208ENST00000567065 LUZP6Q538Z0 58 aa4.37□□□□□ -1.71
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.36□□□□□ -1.71
INO80E-208ENST00000567065 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.3□□□□□ -1.72
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.27□□□□□ -1.73
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.25□□□□□ -1.73
INO80E-208ENST00000567065 MT3P25713 68 aa4.17□□□□□ -1.74
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.13□□□□□ -1.75
INO80E-208ENST00000567065 NDUFAF8A1L188 74 aa4.04□□□□□ -1.76
INO80E-208ENST00000567065 LCE1EQ5T753 118 aa3.81□□□□□ -1.8
INO80E-208ENST00000567065 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.7□□□□□ -1.82
INO80E-208ENST00000567065 H3BS24 57 aa3.68□□□□□ -1.82
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.64□□□□□ -1.83
INO80E-208ENST00000567065 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.57□□□□□ -1.84
INO80E-208ENST00000567065 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.57□□□□□ -1.84
INO80E-208ENST00000567065 LCE1CQ5T751 118 aa3.53□□□□□ -1.84
INO80E-208ENST00000567065 A0A0A0MQY5 61 aa3.5□□□□□ -1.85
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.46□□□□□ -1.86
INO80E-208ENST00000567065 INE1O15225 51 aa3.41□□□□□ -1.86
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.27□□□□□ -1.89
INO80E-208ENST00000567065 LCE1FQ5T754 118 aa3.23□□□□□ -1.89
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
INO80E-208ENST00000567065 PHGR1C9JFL3 82 aa3.07□□□□□ -1.92
INO80E-208ENST00000567065 PRM1P04553 51 aa2.94□□□□□ -1.94
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.69□□□□□ -1.98
INO80E-208ENST00000567065 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.66□□□□□ -1.98
INO80E-208ENST00000567065 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.34□□□□□ -2.03
INO80E-208ENST00000567065 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.93□□□□□ -2.1
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