RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE3A	Q5TA76	89 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PPP4C-208	ENST00000564966	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		8.95	□□□□□ -0.98
PPP4C-208	ENST00000564966	MT4	P47944	62 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE4A	Q5TA78	99 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PPP4C-208	ENST00000564966	PRR15L	Q9BU68	103 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		8.84	□□□□□ -0.99
PPP4C-208	ENST00000564966	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		8.84	□□□□□ -1
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		8.64	□□□□□ -1.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PRO0628	Q9UI54	55 aa		8.62	□□□□□ -1.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP12-3	P60328	96 aa		8.61	□□□□□ -1.03
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		8.61	□□□□□ -1.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		8.59	□□□□□ -1.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		8.58	□□□□□ -1.04
PPP4C-208	ENST00000564966		V9GYY9	64 aa		8.57	□□□□□ -1.04
PPP4C-208	ENST00000564966	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		8.56	□□□□□ -1.04
PPP4C-208	ENST00000564966		Q1T7F1	81 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PPP4C-208	ENST00000564966	UQCR11	O14957	56 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PPP4C-208	ENST00000564966	BRK1	Q8WUW1	75 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PPP4C-208	ENST00000564966	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		8.31	□□□□□ -1.08
PPP4C-208	ENST00000564966		K7ERS5	55 aa		8.27	□□□□□ -1.09
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	8.21	□□□□□ -1.1
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP12-4	P60329	112 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PPP4C-208	ENST00000564966	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PPP4C-208	ENST00000564966	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PSPHP1	O15172	72 aa		8.13	□□□□□ -1.11
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		8.1	□□□□□ -1.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PMAIP1	Q13794	54 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PPP4C-208	ENST00000564966		A6NED7	52 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PPP4C-208	ENST00000564966	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PPP4C-208	ENST00000564966	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PPP4C-208	ENST00000564966	MT1A	P04731	61 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PPP4C-208	ENST00000564966	ROMO1	P60602	79 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-8	O75690	187 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPP4C-208	ENST00000564966	PRAC1	Q96KF2	57 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PPP4C-208	ENST00000564966	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PPP4C-208	ENST00000564966	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC5AC	P98088	5654 aa		7.09	□□□□□ -1.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MT3	P25713	68 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		6.79	□□□□□ -1.32
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BS24	57 aa		6.5	□□□□□ -1.37
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE1E	Q5T753	118 aa		6.44	□□□□□ -1.38
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PPP4C-208	ENST00000564966	NDUFAF8	A1L188	74 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PPP4C-208	ENST00000564966	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6	□□□□□ -1.45
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0A0MQY5	61 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PPP4C-208	ENST00000564966	INE1	O15225	51 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE1F	Q5T754	118 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PPP4C-208	ENST00000564966	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PPP4C-208	ENST00000564966	PRM1	P04553	51 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPP4C-208	ENST00000564966	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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