RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-209ENST00000561191 MT1LQ93083 61 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 MT1GP13640 62 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP12-3P60328 96 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 MT1MQ8N339 61 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 PP632Q6XCG6 107 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-AS1-209ENST00000561191 ROMO1P60602 79 aa6.41□□□□□ -1.38
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.41□□□□□ -1.38
USP3-AS1-209ENST00000561191 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.38
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.13□□□□□ -1.43
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE4AQ5TA78 99 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-AS1-209ENST00000561191 BRK1Q8WUW1 75 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.1□□□□□ -1.43
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE1DQ5T752 114 aa6.09□□□□□ -1.43
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 MT4P47944 62 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6□□□□□ -1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.97□□□□□ -1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.92□□□□□ -1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.78□□□□□ -1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 PMAIP1Q13794 54 aa5.73□□□□□ -1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.73□□□□□ -1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.71□□□□□ -1.5
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP12-4P60329 112 aa5.71□□□□□ -1.5
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.67□□□□□ -1.5
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USP3-AS1-209ENST00000561191 MT1AP04731 61 aa5.64□□□□□ -1.51
USP3-AS1-209ENST00000561191 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.63□□□□□ -1.51
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRAC1Q96KF2 57 aa5.54□□□□□ -1.52
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRO0628Q9UI54 55 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.3□□□□□ -1.56
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.26□□□□□ -1.57
USP3-AS1-209ENST00000561191 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.15□□□□□ -1.59
USP3-AS1-209ENST00000561191 MT3P25713 68 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-8O75690 187 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-209ENST00000561191 SVIPQ8NHG7 77 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-209ENST00000561191 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE1EQ5T753 118 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.64□□□□□ -1.67
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USP3-AS1-209ENST00000561191 LUZP6Q538Z0 58 aa4.53□□□□□ -1.68
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USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.41□□□□□ -1.7
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USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE1CQ5T751 118 aa4.32□□□□□ -1.72
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.18□□□□□ -1.74
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USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.88□□□□□ -1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.7□□□□□ -1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 LCE1FQ5T754 118 aa3.7□□□□□ -1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHGR1C9JFL3 82 aa3.36□□□□□ -1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.35□□□□□ -1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRM1P04553 51 aa3.32□□□□□ -1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 A0A0A0MQY5 61 aa3.13□□□□□ -1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 INE1O15225 51 aa3.13□□□□□ -1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.99□□□□□ -1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 H3BS24 57 aa2.57□□□□□ -2
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.4□□□□□ -2.03
USP3-AS1-209ENST00000561191 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.19□□□□□ -2.06
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