RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	EYS	Q5T1H1	3165 aa		-0.14	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		-0.15	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	USH2A	O75445	5202 aa		-0.15	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	NEB	P20929	6669 aa		-0.15	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	-0.15	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP250	Q9BV73	2442 aa		-0.16	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		-0.17	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		-0.17	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		-0.17	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC2	O95714	4834 aa		-0.18	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DMD	P11532	3685 aa		-0.18	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		-0.18	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DNHD1	Q96M86	4753 aa		-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BSH0	61 aa		-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		-0.19	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SZT2	Q5T011	3432 aa		-0.2	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A096LNI7	61 aa		-0.2	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		-0.2	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	MT4	P47944	62 aa		-0.21	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB4A	O15263	64 aa		-0.22	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		-0.22	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		-0.22	□□□□□ -2.44
AKAP13-223	ENST00000560957	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		-0.23	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	-0.23	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RYR3	Q15413	4870 aa		-0.24	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RYR1	P21817	5038 aa		-0.24	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	HTN1	P15515	57 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RYR2	Q92736	4967 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1HL1	P0DM35	61 aa		-0.26	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1M	Q8N339	61 aa		-0.26	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF213	Q63HN8	5207 aa		-0.26	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PCNT	O95613	3336 aa		-0.26	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		-0.26	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		-0.27	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		-0.27	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MT2A	P02795	61 aa		-0.27	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	-0.27	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		-0.28	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1G	P13640	62 aa		-0.28	□□□□□ -2.45
AKAP13-223	ENST00000560957	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		-0.3	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	CD52	P31358	61 aa		-0.31	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPE	Q02224	2701 aa		-0.31	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP350	Q5VT06	3117 aa		-0.32	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		-0.32	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		-0.32	□□□□□ -2.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		-0.38	□□□□□ -2.47
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		-0.39	□□□□□ -2.47
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		-0.39	□□□□□ -2.47
AKAP13-223	ENST00000560957	USP34	Q70CQ2	3546 aa		-0.39	□□□□□ -2.47
AKAP13-223	ENST00000560957	EP400	Q96L91	3159 aa		-0.39	□□□□□ -2.47
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1B	P07438	61 aa		-0.42	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957	APELA	P0DMC3	54 aa		-0.42	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		-0.43	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9Y3F1	56 aa		-0.46	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957	SPEG	Q15772	3267 aa		-0.47	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A096LPF7	62 aa		-0.47	□□□□□ -2.48
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		-0.48	□□□□□ -2.49
AKAP13-223	ENST00000560957	BRCA2	P51587	3418 aa		-0.48	□□□□□ -2.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1F	P04733	61 aa		-0.49	□□□□□ -2.49
AKAP13-223	ENST00000560957	VCAN	P13611	3396 aa		-0.53	□□□□□ -2.49
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
AKAP13-223	ENST00000560957	UTRN	P46939	3433 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		-0.59	□□□□□ -2.5
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		-0.6	□□□□□ -2.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPF	P49454	3210 aa		-0.6	□□□□□ -2.51
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		-0.66	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	-0.67	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		-0.67	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	COX14	Q96I36	57 aa		-0.67	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		-0.68	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH23	Q9H251	3354 aa		-0.69	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	HTN3	P15516	51 aa		-0.69	□□□□□ -2.52
AKAP13-223	ENST00000560957	STATH	P02808	62 aa		-0.76	□□□□□ -2.53

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