RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP12-3P60328 96 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE4AQ5TA78 99 aa6.41□□□□□ -1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.4□□□□□ -1.38
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-9P26371 169 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1EP04732 61 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.27□□□□□ -1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.15□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.15□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1LQ93083 61 aa6.13□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2EP22531 72 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2BP35325 72 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2AP35326 72 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.1□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.1□□□□□ -1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEBP20929 6669 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1GP13640 62 aa6.03□□□□□ -1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MDN1Q9NU22 5596 aa6□□□□□ -1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE3CQ5T5A8 94 aa6□□□□□ -1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1MQ8N339 61 aa5.93□□□□□ -1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2DP22532 72 aa5.91□□□□□ -1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.83□□□□□ -1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.81□□□□□ -1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.69□□□□□ -1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 LUZP6Q538Z0 58 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.64□□□□□ -1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFAF8A1L188 74 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.25□□□□□ -1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1AP04731 61 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT4P47944 62 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP12-4P60329 112 aa5.1□□□□□ -1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT3P25713 68 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0A0MQY5 61 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.51□□□□□ -1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.5□□□□□ -1.69
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.46□□□□□ -1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 INE1O15225 51 aa4.42□□□□□ -1.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.21□□□□□ -1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1EQ5T753 118 aa4.18□□□□□ -1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-8O75690 187 aa4.17□□□□□ -1.74
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.13□□□□□ -1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.11□□□□□ -1.75
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1CQ5T751 118 aa3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUC5ACP98088 5654 aa3.88□□□□□ -1.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRM1P04553 51 aa3.74□□□□□ -1.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1FQ5T754 118 aa3.52□□□□□ -1.85
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.37□□□□□ -1.87
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHGR1C9JFL3 82 aa2.97□□□□□ -1.93
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.61□□□□□ -1.99
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.22□□□□□ -2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.9 ms