RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557294.5

PRKCH-223, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-223	ENST00000557294		A0A1B0GU33	70 aa		6	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		6	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		6	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	COX7C	P15954	63 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PRKCH-223	ENST00000557294	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PRKCH-223	ENST00000557294	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PRKCH-223	ENST00000557294		H7BZZ5	65 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PRKCH-223	ENST00000557294	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PRKCH-223	ENST00000557294	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PRKCH-223	ENST00000557294		A0A1B0GU69	56 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PRKCH-223	ENST00000557294	TNP1	P09430	55 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PRKCH-223	ENST00000557294	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRKCH-223	ENST00000557294		A8MU10	97 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRKCH-223	ENST00000557294	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRKCH-223	ENST00000557294	PCP4	P48539	62 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRKCH-223	ENST00000557294	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRKCH-223	ENST00000557294	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PRKCH-223	ENST00000557294	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
PRKCH-223	ENST00000557294	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PRKCH-223	ENST00000557294	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PRKCH-223	ENST00000557294		H3BS24	57 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PRKCH-223	ENST00000557294	MT1A	P04731	61 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PRKCH-223	ENST00000557294	UQCR11	O14957	56 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PRKCH-223	ENST00000557294	TMEM258	P61165	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PRKCH-223	ENST00000557294	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PRKCH-223	ENST00000557294		K7ERS5	55 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PRKCH-223	ENST00000557294	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRKCH-223	ENST00000557294		V9GYY9	64 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRKCH-223	ENST00000557294	PSPHP1	O15172	72 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PRKCH-223	ENST00000557294		Q1T7F1	81 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-223	ENST00000557294	MT3	P25713	68 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-223	ENST00000557294		A6NED7	52 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-223	ENST00000557294	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-223	ENST00000557294	ROMO1	P60602	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCH-223	ENST00000557294	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRKCH-223	ENST00000557294	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRKCH-223	ENST00000557294	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCH-223	ENST00000557294	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PRKCH-223	ENST00000557294	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRKCH-223	ENST00000557294	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRKCH-223	ENST00000557294	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRKCH-223	ENST00000557294		A0A0A0MQY5	61 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PRKCH-223	ENST00000557294	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PRKCH-223	ENST00000557294	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKCH-223	ENST00000557294	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKCH-223	ENST00000557294	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PRKCH-223	ENST00000557294	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRKCH-223	ENST00000557294	INE1	O15225	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PRKCH-223	ENST00000557294	PRM1	P04553	51 aa		2.46	□□□□□ -2.02
PRKCH-223	ENST00000557294	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.38	□□□□□ -2.03

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