RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554360.5

PSMA3-AS1-204, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 2,475 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SSPOA2VEC9 5147 aa3.96□□□□□ -1.78
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.92□□□□□ -1.78
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 TNP1P09430 55 aa3.9□□□□□ -1.78
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.82□□□□□ -1.8
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP10-12P60413 245 aa3.78□□□□□ -1.8
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE1FQ5T754 118 aa3.63□□□□□ -1.83
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP12-3P60328 96 aa3.59□□□□□ -1.84
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.58□□□□□ -1.84
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.57□□□□□ -1.84
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.54□□□□□ -1.84
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE1EQ5T753 118 aa3.47□□□□□ -1.85
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MT3P25713 68 aa3.43□□□□□ -1.86
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.41□□□□□ -1.86
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MT1LQ93083 61 aa3.41□□□□□ -1.86
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP12-4P60329 112 aa3.37□□□□□ -1.87
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.34□□□□□ -1.87
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MDN1Q9NU22 5596 aa3.33□□□□□ -1.88
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SPRR2EP22531 72 aa3.33□□□□□ -1.88
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SPRR2BP35325 72 aa3.33□□□□□ -1.88
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SPRR2AP35326 72 aa3.33□□□□□ -1.88
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MT1MQ8N339 61 aa3.3□□□□□ -1.88
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 NEBP20929 6669 aa3.25□□□□□ -1.89
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 SPRR2DP22532 72 aa3.21□□□□□ -1.9
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.19□□□□□ -1.9
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.09□□□□□ -1.91
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.09□□□□□ -1.91
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.06□□□□□ -1.92
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.06□□□□□ -1.92
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.03□□□□□ -1.92
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3□□□□□ -1.93
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.91□□□□□ -1.94
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PSMA3-AS1-204ENST00000554360 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.74□□□□□ -1.97
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PRM1P04553 51 aa2.69□□□□□ -1.98
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.69□□□□□ -1.98
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.66□□□□□ -1.98
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.61□□□□□ -1.99
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.6□□□□□ -1.99
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.46□□□□□ -2.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.41□□□□□ -2.02
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.36□□□□□ -2.03
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE1CQ5T751 118 aa2.27□□□□□ -2.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.27□□□□□ -2.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP5-8O75690 187 aa2.26□□□□□ -2.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MUC5ACP98088 5654 aa2.21□□□□□ -2.05
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.99□□□□□ -2.09
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.95□□□□□ -2.1
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.88□□□□□ -2.11
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 PHGR1C9JFL3 82 aa1.63□□□□□ -2.15
PSMA3-AS1-204ENST00000554360 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.04□□□□□ -2.24
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