RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985		Q1T7F1	81 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MU10	97 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2D	P22532	72 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TPCN1-223	ENST00000552985		K7ERS5	55 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1E	P04732	61 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TPCN1-223	ENST00000552985	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TPCN1-223	ENST00000552985	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985	UQCR11	O14957	56 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985		A6NED7	52 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985	TNP1	P09430	55 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPCN1-223	ENST00000552985	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1G	P13640	62 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1L	Q93083	61 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TPCN1-223	ENST00000552985	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ROMO1	P60602	79 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1M	Q8N339	61 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MT4	P47944	62 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TPCN1-223	ENST00000552985	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TPCN1-223	ENST00000552985	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TPCN1-223	ENST00000552985	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1A	P04731	61 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TPCN1-223	ENST00000552985	INE1	O15225	51 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TPCN1-223	ENST00000552985	MT3	P25713	68 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TPCN1-223	ENST00000552985	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TPCN1-223	ENST00000552985	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.24	□□□□□ -2.05
TPCN1-223	ENST00000552985	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TPCN1-223	ENST00000552985	PRM1	P04553	51 aa		1.92	□□□□□ -2.1
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.85	□□□□□ -2.11
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.5	□□□□□ -2.17
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.35	□□□□□ -2.19

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